山羊地方性鼻内肿瘤病毒Shaanxi株前病毒全基因组克隆及生物信息学分析.pdf

第 39卷 第 1期 中 国 预 防 兽 医 学 报 Vo1．39，NO．1 2017 年 1月 ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicine Jan． 2017 doi：10．3969~．issn．1008—0425．2017．01．15 山羊地方性鼻内肿瘤病毒Shaanxi株 前病毒全基因组克隆及生物信息学分析 何亚鹏 ，付 明哲 ，许信刚，庞文静 ，王 景 ，周 曼，张 琪 (西北农林科技大学动物医学院，陕西杨凌712100) 摘 要 ：为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基 因组序列，本研究根据GenBank中收 录的ENTV前病毒基因组序列设计 5对引物，通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得 了ENTV前病毒全基因 组的5个片段，测序并分析。结果显示该病毒基因组全长 7275bp，包含相互重叠的gag—pro-pol—env编码区及 5’ 端非编码 区；ENTVShaanxi株基 因组全序列与NC004994．2、AY197548．2、ENTV．SC株 (HM104174．11核苷酸同源 性分别为 89％、89％、99％。本研究为ENTV的分子生物学特性研究提供资料 ，为进一步研究其检测方法与致 病机理奠定 了基础 。 关键词：山羊；地方性鼻 内肿瘤病毒；全基因克隆；生物信息学分析 中图分类号 ：$852．65 文献标识码 ：A 文章编号 ：1008—0589(2017)01．0063—04 Completegenomiccloningandbioinformaticsanalysisofgoat enzooticnasaltumOrvirusShaanxistrain HEYa-peng，FUMing—zhe，XUXin-gang，PANGWen-jing，WANGJing，ZHOUMan，ZHANGQi (CollegeofVeterinaryMedicine，No~hwestAFUniversity，Yangling712100，China) Abstract：Inordertoanalyzethecompletegenomeofenzooticnasaltumorvirus(ENTV)Shaanxistrain，fivepairsofprimers weredesignedbased on ENTV sequencesin GenBank．Thecompletesequenceofthevirusweresequenced from hteENTV provirusandanalyzed．Theresultsshowedhtatthegenomewas7，275bpinlengthand containedfouroverlappingORFsofhte gag，pro，poland envgenesand 5’LTR．Thenucleotideacid sequencesofShaanxistrainwere comparedwiht hteENTV sequencesofNC004994．2，AY 197548．2andHM 104174．1，htenucleotideidentitieswere89％，89％ and99％ ，respectively．The fulllengthgenomiccloneandsequencinganalysisofENTV Shaanxistrainprovidebasicdataforhtestudyofmolecularbiology characteristicsandpathogenesisofENTV． Keywords：goat；enzooticnasaltumorvirus；completegenomiccloning；bioinformaticsanalysis *Correspondingauhtor 收稿 日期 ：2016—05—05