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急性髓系白血病细胞单链DNA适体的体外筛选
中南大学学报(医学版)
2012, 37(8) ;
J Cent South Univ (Med Sci) 771
急性髓系白血病细胞单链 DNA 适体的体外筛选
朱平,王光平,张书芹,徐雅静,彭敏源,银辉,陈焱,谭三勤,陈方平
( 中南大学湘雅医院血液科,长沙 410008)
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[ 摘要 ] 目的:筛选识别急性髓系白血病 M2 型(acute myeloblastic leukemia M2 subtype,AML M2)CD33 /CD34
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细胞的核酸适体 (aptamers)。方法:以 AML M2 型白血病 CD33 /CD34 细胞为靶细胞,正常人 CD33 /CD34 细胞为反
筛选细胞,采用细胞 - 指数富集配体系统进化 (cell-systematic evolution of ligands by exponential enrichment,C-SELEX)
技术,体外反复筛选单链 DNA(single strand deoxyribonucleic acid,ssDNA)文库的适体,经聚合酶链式反应 (polymerase
chain reaction,PCR) 扩增产生次级文库。然后将最终轮次的次级 ssDNA 文库克隆、测序并分析各适体的一级和二级
结构。结果:琼脂糖凝胶电泳结果显示:每轮筛选出来的次级 ssDNA 文库 PCR 扩增产物均可见到清晰的 DNA 条带。
经过 13 轮的反复筛选,次级 ssDNA 文库与细胞结合的荧光强度从 2.14% 上升到 51.12%,至第 13 轮趋于稳定状态。
对 30 个克隆子序列测定结果显示:22 个适体一级结构分别含有 AAGTA,TATCT,AGATG 和 AAATT 4 个保守序列,
另 8 个适体无此保守序列。二级结构模拟结果显示:30 个适体含有 4 种不同的茎环、凸环模拟结构。结论:C-SELEX
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- /CD34 细胞适体有望用于白血
技术可用于急性髓系白血病原代细胞适体的筛选,筛选到的 AML M2 型白血病 CD33
病的诊断与治疗。
[ 关键词 ] 细胞 - 指数富集配体系统进化;急性髓系白血病,M2 型;适体
DOI:10.3969/j.issn.1672-7347.2012.08.003
In vitro selection of single strand deoxyribonucleic acid
aptamers binding to cells from patients with acute
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