蛋白质折叠的不可逆热力学理论与能级相图理论.pdfVIP

《生命的化学》2010年30卷3期 ● 学术争鸣 · 323 · CHEMISTRY OF LIFE 2010，30(3) 文章编号: 1000-1336(2010)03-0323-06 蛋白质折叠的不可逆热力学理论与能级相图理论 赵钦一 中国康复研究中心医学研究所，北京 100068 摘要：蛋白质折叠指没有任何固定结构形式的蛋白质多肽链经过复杂作用，转化成活性蛋白质结构的物理学过程。 蛋白质折叠的理论研究是理论生物学的基本内容。它对蛋白质工程、蛋白质结构的预测、蛋白质结构与功能的关 系、生物疾病的发生机理等有重大的科学指导意义。蛋白质折叠的传统理论是Anfinsen提出的。目前有两种不同 的热力学理论：蛋白质折叠的不可逆热力学理论与能级相图理论。本文重点分析、讨论了蛋白质折叠的不可逆热 力学(irreversible thermodynamics)理论和能级相图(energy landscape)理论的共同点与分歧。 关键词：蛋白质；折叠；能量；理论；热力学 中图分类号：Q51 蛋白质折叠是生物信息从基因传递到蛋白质功 上的质疑，我们总结下面几点：(1)蛋白质的变性与 能过程中的核心步骤，阐明蛋白质折叠的科学原理 复性是在不同条件下进行的，不符合热力学准静态 是数学、物理、生物物理、生物化学、分子生物学 过程(或平衡热力学过程)的标准，在严格的热力学 和理论生物学的核心科学任务之一。它的重要性是 逻辑上推导不出他的结论；(2)如果天然蛋白质处于 [1] 不言而喻的。蛋白质折叠的研究从Anfinsen开始， 热力学最稳态，那么蛋白质的变性特点就变得很难 [7] 几经理论修改，目前有大量不同的假说，其中建立 理解；(3)Levinthal证明，在有限的时间内，天然蛋 在热力学理论基础上的折叠理论有两种:能级相图 白质通过热力学碰撞机制寻找热力学最稳态是不可 [2-4] (energy landscape)理论 和不可逆热力学(irreversible能的；(4)如果天然蛋白质处于热力学最稳态，那么 [5,6] thermodynamics)理论 。本文从蛋白质折叠的发展 蛋白质折叠途径的概念在理论上就不是必需的。由 过程阐述分析了两种理论发展的背景及二者之间的 于蛋白质变、复性过程中的能量变化很小，无法在 联系与区别。以帮助读者更好地理解蛋白质折叠的 实验的基础上判定这个假说的正确性，所以争论长 热力学理论研究。 期存在，无法解决。 1. Anfinsen的理论观点 对Anfinsen观点的质疑导致了蛋白质折叠新理 Anfinsen的工作是蛋白质折叠实验和理论科学 论的产生，这就是蛋白质折叠的能级相图理论理论 [1] 和不可逆热力学理论。目前大家公认蛋白质折叠为 研究的起点 。在大量实验和平衡热力学原理的基 础上，Anfinsen提出了下面几个观点：(1)在体外天然 复杂的不可逆热力学过程，蛋白质折叠是有一定途 [8] 蛋白质多肽链可以复性；(2)蛋白质序列含有蛋白质 径的，蛋白质折叠是自组织现象 。 折叠的全部信息；(3)天然蛋白质在生物学环境下处 2.蛋白质折叠的能级相图(energy landscape)理论 于热力学最稳