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作物抗旱的分子机制课案
作物生理报告;小组成员;1.简介;
本研究团队将参考植物拟南芥的3日龄幼苗暴露于脱落酸，并在固定的时间点上检查基因表达，总共超过60h。在这个过程中，他们收集了122个数据集，涉及33602个基因其中3061个基因是在至少一个时间点中不同表达上表达的。数据的分析显示了一个层次结构的控制，一些调控蛋白被列为基因表达最重要的贡献者。有趣的是，在一个特定的时间点上蛋白结合模式的快照，可以在很大程度上解释“大的跨度上的基因表达”，总之，这些动态显示出，对环境触发因子有一个协调的全基因组响应。有了这个网络视图，我们可以看到，这些组件中的一些，是由相同的主调节蛋白靶定的，这表明精确和协调的遗传控制。这对于农业用途可能是重要的，因为调节一个基因反过来可能会刺激或抑制另一组基因，从而让我们全面设计干预措施。;2.ABA反应的ChIP-seq分析;3.激素对转录因子结合和靶基因表达的影响;;;;;4.不同TF结合的决定因素;;5.ABA反应网络的构建;6.结论; 我们的实验数据将提供植物群落中由21个ABA相关的TFs转录调控的ABA的路线图。我们认为动态的、多TF绑定可以作为对可能的TF绑定元件的特征，顺式调控元件和在植物和其他生物中未知基因功能的顺序优选的标准。在我们的验证试验中，转录调控子在ABA灵敏度改变和高盐度的环境下，它的异常表达在我们的模拟结果中排名非常高。
总之，综合事实和我们模拟的与种子发育和渗透压相关的基因的实验，我们相信这些预测很有可能适用于有关发育阶段和渗透压的一个很广的范围。;7.DREM和个体TFs对基因的贡献建模;7.共焦成像 ;8.DIGs及其同源物的序列分析;Thanks!
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