合成生物学和仿生化学作为会聚技术促进新一代生物传感器的发展精要
合成生物学和仿生化学作为会聚技术促成了新一代智能生物传感器的产生
Viviana Scognamiglio a,n, Amina Antonacci a, Maya D. Lambreva a, Simona C. Litescu b,Giuseppina Rea a
摘 要 生物传感器是强大的可调系统,能够在响应外部刺激的ON / OFF状态之间切换。根据对于稳定性、敏感度以及检测范围的不同需求,这种特殊的性质可以通过合成生物学和仿生化学的方式来定向改造。事实上,最近这两个学科的优势主要体现在对于传感器的重复设计上,所采用的方法有两种,一是修饰双态开关和基因网络,另一种是生产模仿天然分子的主要产物的主体。
根据文献中的资料,以及对合成生物学作为一个有用工具在感应元件的应用中所进行的设计和建设的回顾,现在的观点认为其在维护生物传感器技术上扮演着重要的作用。此外,报告了专用于生物激发的合成分子作为强化生物传感器电位的强大工具的部分,并且作为生物模拟化学的概念的延伸,其中有机合成用于产生模拟天然分子的人工分子。因此,诸如适体、仿生产物、分子印迹多聚体、肽核酸、以及核糖体这种人工合成分子的设计,都属于仿生化学的产物。
1 引言
大众对于生物传感器的关注促使新的技术的研究不断前进,以求获得更多智能的特征,尽管这一过程需要面临新的感应系统以及传感器在商业上的应用的挑战。虽然这项技术有了许多革新和进步,但生物传感器市场依然被许多因素限制,比如长时间的稳定性、敏感度、读出时间以及微型化。这里要特别指出的是,生物传感器未来革新的最主要的挑战是降低检测范围的限制性并提高性能的稳定性。合成生物学可以通过放大生物系统的初始反应并编辑它们产生新的期望产物来定向解决这些关键问题,借此提高敏感性、稳定性、选择性以及在复杂环境中的分析能力,从这四个方面来提高生物传感器的潜力。
合成生物学出现于二十世纪晚期,最初通过重新设计蛋白质、基因、代谢途径和复杂的生物系统来了解生物有机体的基础生命活动,并获得新的和有优势的功能。为了实现这一目标,需要很多学科的共同参与,比如基因组学、化学、工程学、数学和电脑建模。考虑到新的仿生生物合成产物被应用于新药、化学物质、燃料以及可再生生物量的材料的生产的进展,合成生物学因采用多学科参与的手段解决问题的方式在近年来大受欢迎。与纳米技术相同,合成生物学最近也在广泛领域里显示了其具有很大上升空间的潜能,从制药到生物医药再到生物防治、环境问题、农产品等方面,都取得了瞩目的成就。 Nigel M. de S Cameron写到:“当哪个行业的前景像合成生物学一样得到了《纽约客》这样的评价,那我们就可以说它至少在这个情景中已经妥妥的算是翘楚了。”确实,在2011年合成生物学的全球市场价值已经达到1.537.5百万美元,并且按照其在2010到2018年间的41.1%的增长速度,它在2018年市值可达到16.745百万美元。
如先前所讨论的,合成生物学的无数方法之一涉及生成新的生物系统或重新设计现有的生物系统,用于开发用于感测应用的智能生物识别元件。通过诸如纳米技术,生物信息学和分子工程等技术的进步,快速改进了产生新的生物成分的能力,以解码和重写基因,酶和网络,修饰它们以改变其核心功能和结构,例如底物特异性的分子或生物体。已经采用新兴策略来开发工程生物体以产生对污染物的特异性反应,或设计具有关于特异性和稳定性的定制特征的生物激发分子的组合文库,如肽模拟物,分子印迹聚合物和适体。在将合成生物学概念应用于生物传感器设计之后的最后几年中出现了具有改进的性能和广泛的应用范围的新一代生物传感器。作为一个例子,遗传电路的设计以及因此合成细胞的发展导致了基于能够揭示特定污染物或不利环境条件的基因修饰生物体的第一合成生物传感器的发展。此外,已经通过改变特定基因(转录生物传感器)的转录,改变基因表达(翻译生物传感器)或响应于化合物(翻译后生物传感器)调节信号转导途径而开发了几种生物传感器。在这方面,合成生物系统可以为在若干应用领域中扩大生物传感器的潜力铺平道路。 生物传感器技术可以取得显著进步的领域之一是医疗保健。基于合成生物学的生物传感器可以用于特定类型异常的可植入感测,例如癌症或动脉疾病。类似的生物传感器可以是能够合成药物以杀死癌症或分散动脉斑的遗传工程机器的一部分。然而,与环境和农产品应用有关的一些有趣的发展涉及用于检测饮用水或食品中的污染物的生物传感器。合成生物传感器可以是显示爆炸物和有害化学物质的有用工具,或者可以整合在净化过程链中以在大规模上产生清洁水。另一方面,考虑到“合成生物学”和“仿生化学”被视为“跨境双向交通”的BensaudeVincent(2009)的文章,并讨论了这些技术在什么程度上是对称的 所提出的手稿旨在将
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