抗体正则结构教案.pptVIP

2012.9 摘要 对17个免疫球蛋白高可变区L1 L2 L3 H1 H2主链结构的79个高可变区进行比较分析。 79个高可变区关键位点的基本残基被归纳为18个不同的正则结构。其中的71个高可变区的正则结构都非常接近 “标准”构象。其余的8个高可变区与标准构象有些小的差异。在这当中，大多数H3高可变区有相同的构象且接近框架区。 介绍 免疫球蛋白的抗原结合位点由六个高可变区组成：三个来自VL区域，三个来自VH区域。尽管这些区域在序列和大小方面有很大的差异，但各种研究表明，这六个高可变区中的五个通常有一个小数量的主链结构，这被称为正则结构。在一个抗体中，这五个区域与抗原特异性结合的主要决定因素是：（1）出现在高可变区的正则结构；（2）其表面残基的大小，形状和化学特征；（3）彼此的相对位置。 免疫球蛋白结构及其结合位点框架图 介绍 特殊的正则结构的构象是由环区和出现在关键位点的残基决定的。正则结构的局部构象是十分保守的。我们通过分析和比对具有高分辨率精确确定其结构的17个免疫球蛋白正则结构的构象提供这些信息。尽管在这些特殊免疫球蛋白中的高可变区确实没有覆盖所有的已知正则结构，但他们包括了所有经常发生的情况。我们给出的这些说明对于合理理解免疫识别的分子机制至关重要。对于涉及到抗体结构的设计或建模也同样重要。 精确高分辨率的免疫球蛋白结构 就像上面提到的一样，在高分辨率下得到的17个结构用于本文的研究。包括7个Vλ ，10个Vk和15个VH链。表1给出这些结构的清单和它们一些基本信息的概括。 L1高可变区 Vk L1 正则结构 L1区域在Vk区域的顶端，连接两个β折叠片。基于序列不同，残基24-34作为第一个CDR区被Kabat等人（1979）定义。该区域残基数量不同，这些不同的类型在27号位点上包含残基插入或缺失。免疫球蛋白结构的分析表明，β折叠片框架区外的区域潜在可能由残基26-32组成的不同构象。在残基30之后这些大小不同的区域包含插入和缺失。在表2 中，我们给出了Kabat和位于Vk L1高可变区残基结构编号。 Vk L1 正则结构 这些区域的六个正则结构已经被确定；几乎所有的人类种系在表达Vk区域在其L1区都有正则结构2，3，4或6。检查老鼠种系序列和VK区域表达表明，他们几乎所有的L1区都有在人类抗体中找到的2，3，4，6四个中的一个，或含有非人类抗体中找到的的1，5两个中的一个。 …… …… 谢谢~~