血清白蛋白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系.pdf

第 l5卷 第 1期 生 物 信 息 学 V01．15No．1 2017年03月 ChineseJourna1ofBioinformatics Mar．20l7 DOI：10．3969／j．issn．1672—5565．2017．01．201608002 血清 白蛋 白与抗肿瘤药物莪术醇的相互作用关系 齐燕姣 ，陆会宁 ，金能智 (1．西北民族大学榆中校区化工学院，兰州 730124； 2．西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院，兰州 730124； 3．甘肃省计算中心，兰州 730000) 摘 要：莪术醇是近年来发现的重要的新的抗肿瘤中药单体之一。分析莪术醇与转运蛋 白一血清 白蛋 白之间的相互作用能 够帮助研究者更好的理解药物的作用机制。本文通过用 多序列分析、进化关系和分子对接技术等分析莪术醇与人血清 白蛋 白相互作用位点及其在其他亲缘关系较近的物种中的特点。结果表明，莪术醇与人血清 白蛋 白相互作用的结合位点II和 III 处周围几乎都是疏水性的氨基酸，分子 间的疏水作用起着很重要 的作用，其最低 结合 能分别是一7．22Kcal／mol和 一 8．34Kcal／mol。莪术醇与人血清 白蛋白之间的作用位点在其他亲缘关系较近的狼(c一 lupus)、绵羊(Ovine)、牦牛(Bosmu— tus)、家牛(BosTaurus)物种中都较为保守，少数有变化的氨基酸基本是在极性相同的氨基酸之间发生的。与分子相互作用前 的结构相比，莪术醇中的羟基的结构在活性位点处发生了最明显的变化。 关键词：莪术醇；血清 白蛋 白；相互作用；序列比对；亲缘关系 中图分类号：R730．3 文献标志码：A 文章编号：1672—5565(2017)0卜059—10 Interactionanalysisofthecurcumolandhomosapiensserum albumin QIYanjiao ，LUHuining，JINNengzhi (1．DepartmentofChemicalEngineering，NorthwestUniversityforNationalities，Lanzhou730124，China； 2．DepartmentofLfieSciencesandBiologicalEngineering，NorthwestUniversityforNationalities，Lanzhou730124，China； 3．GansuProvinceComputingCenter，Lanzhou730000，China) Abstract：Recently，curcumolisoneoftheimportantnew anti-tumortraditionalChinesemedicinemonomer．Itcan helpUStobetterunderstandthemechanism ofdrug’Sactionbyanalyzingtheinteractionbetweencurcumoland transporter—seurm albumin．In thispaper，weanalyzed themolecularinteraction between curcumoland human serum albumin，aswellasthecharacteristicsinothercloselyrelatedspeciesbyusingmuhiplesequenceanalysis， evolutionaryrelationship and moleculardocking technique．Theresuhsshowed thattheactive sites IIand III betweencurcumolandhuman seurm albuminsaresurroundedbyhydrophobicaminoa