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癌症诊断与DNA甲基化的研究
班级:临床三班 学号:201108010302 作者:李然
摘要 DNA甲基化异常是人类肿瘤中常见的表观遗传变化之一,伴随着肿瘤的发生和发展,且该异常现象在肿瘤患者的外周循环血清、血浆和尿液等体液中都可检测到。因此,利用DNA甲基化分析技术检测体液中特定分子DNA甲基化水平是肿瘤早期诊断、病程监控和疗效评估的潜在手段,对临床肿瘤 的诊治意义重大。
关键词 DNA甲基化;肿瘤诊断
随着人类基因组测序工作的基本完成,深入研究生命过程中基因表达的调控及其在疾病发生中的异常,已成为这一领域的关键课题之一。在这一背景下,以不改变基因组的碱基序列只改变基因组的修饰为研究内容的表观遗传学已成为生命学科的研究前沿,而DNA甲基化修饰是基因组表观遗传调控中主要的方式,它在胚胎发育、转录、染色体结构、P 性染色体失活、基因组印迹和染色体稳定性中起着重要的调控作用。近年越来越多的研 究显示人类肿瘤的发生、发展与DNA甲基化的异常有关,而且早在肿瘤临床确诊之前就可检测出特异 基因的甲基化异常现象。因此特异基因的甲基化可 以作为癌症早期诊断的分子标记物、治疗的靶点和 判断预后手段,这对临床肿瘤的诊治将起着重要的意义。
1、DNA甲基化与肿瘤
基因组甲基化异常包括(DNA过低甲基化Cp G岛高甲基化)与肿瘤发生一直是医学界关注热点之一。细胞周期、DNA修复、血管生成和凋亡等都涉及到相关基因的甲基化。肿瘤细胞DNA总体甲基化水平低于正常细胞,但某些特定基因(如肿瘤抑制基因)Cp G岛却处于高甲基化状态。一方面,局部性的高甲基化通过诱导基因突变、基因缺失、启动子区高甲基化导致基因表达抑制,使抑癌基因丧失功能。其中,局部性的高甲基化诱导基因突变有多方面的原因:一是甲基化后的胞嘧啶更易发生内源性突变,如无酶脱氨的几率增加;二是突变后产生的T:不易被错配修复机制识别恢复;三是其外源性突变几率增高,如对紫外线的物理损伤更加敏感,对化学致癌物的亲和力增加等。
另一方面,全基因组的低甲基化可促使癌基因活化,使逆转座子的转录活性增强及基因的不稳定性增加。如去甲基化可能引起癌基因的非扩增性的过度表达。除厂家肿瘤之外,另有四类特殊的肿瘤,即卵巢囊肿、葡萄胎、部分睾丸肿瘤和异位寄生囊肿,也与单亲遗传和DNA甲基化相关。
肿瘤中异常的DNA甲基化
肿瘤的形成最终源于基因的异常表达,二近些年研究表明DNA甲基化这一表观遗传机制是影响基因表达的重要因素,毫无疑问,DNA甲基化异常在肿瘤生成中起着重要角色,事实上自1983年Feinbreg等首次发现在癌细胞中基因组甲基化水平偏低后,越来越多的实验表明,在肿瘤的发生和发展中存在DNA甲基化水平和模式的混乱,包括基因组总体甲基化水平过低和某些启动子区域甲基化过高(表一),而且不同的肿瘤表型甲基化异常状况也不相同。最近利用细胞核转移技术证实了改编受精卵的表观遗传信息会逆转肿瘤的表型。
表一:几种肿瘤中DNA异常甲基化状况
肿瘤表型 异常高甲基化基因 异常低甲基化 乳腺癌 抑癌基因
修复相关基因
激素反应相关基因
细胞粘连相关基因 p16(INK4a),linel repetitive sequence
BRCA1,hMLH1,HMSH2,Global hypomethyl-ation
SYNUCLEINγ 前列腺癌 细胞周期相关基因
激素反应相关基因
肿瘤细胞转移/侵入相关基因
抑癌基因
修复相关基因 CDKN2A,
CDH1,CD44,APCCYP1B1
AR,ESR1,ESR2,RARRES1,RAR EGR1
KAI-1,CAV1,DAB21P
GSTP1 肺癌 DNA修复基因
细胞周期相关基因
生长相关基因
抑癌基因
凋亡基因 MGMT,BRCA1,hMLH1,hMHL2
P159ink4b)INK4a
ETBR
Hsbrc,RAR-β,TSLC1
DAPK
DNA甲基化在肿瘤诊断上的应用前景
阿基正的早起发现对癌症患者的有效治疗是非常重要的。目前对癌症的诊断主要依据临床症状、直接触诊。图像信号检测、和组织病理学检查等,但也有许多癌症临床症状出现较晚,并且活体取样检测也困难,严重影响了癌症的早期诊断和病人的愈后。然而随着在癌症的发生和发展中DNA甲基化的异常现象的发现,且此现象在确诊前就能被检测出,提示某些基因的DNA甲基化水平有王成伟肿瘤早期诊断的潜在指标,甚至可以作为患病风险的预测、临床病程监控和疗效评估的指标。
4、肿瘤诊断分子标记物
肿瘤诊断分子标记物的确定取决于标记物的灵敏度和特异性,灵敏度是指标记物在癌症患者中能被检出阳性的百分比,而特异性是指在健康对照者中标记物检出阴性的百分比。
灵敏度高特异性好的分子是较理想的肿瘤诊断标记物。目前研究者一般通过甲基化检测方
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