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2-DE为基础的蛋白质组学方法在乳腺癌实际研究中的运用 2-DE为基础的蛋白质组学方法在乳腺癌实 际研究中的运用 494 ??第22卷第5期 ??2007年lO月 ??川北医学院Vo1.22,N..5 ??JOURNALOFNORTHSICHUANMEDICALCOLLEGEOct.2007 ??2一DE为基础的蛋白质组学方法在乳腺癌实际研究中 ??的运用 ??邓世山 ??(川北医学院基础医学院人体解剖学教研室,四川南充637000) ??摘要:蛋白质组(proteome)是指一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的蛋白质.以二维聚丙烯酰胺凝胶电 ??泳(2一DE)为基础的蛋白质组学技术,在阐明乳腺癌潜在的发生机制,寻找与诊断,治疗,预后,耐药等有关分子靶标的研究中 ??有非常重要的地位.目前常用的样本主要有乳腺癌组织,细胞株,乳头吸出液,细胞间质及血清等,蛋白质组学方法对不同的 ??样本蛋白质进行分离鉴定,在一定范围内对某一样本的总蛋白进行分析,是蛋白质组学方法在实际研究中的应用.不同样本 ??来源蛋白具有不同的功能特性,表现形式也存在差异,反映的病理过 程也有所不同.通过对不同来源样本的总蛋白进行分 ??析,可从不同的角度对乳腺癌进行阐述,这在乳腺癌研究中具有重要的意义. ??关键词:乳腺癌;二维聚丙烯酰胺凝胶电泳;蛋白质组;发病机制;生物标记 ??文章编号:1005—3697(2007)05-0494-06中图分类号:R329文献标识码:A ??蛋白质组(proteome)是指一个细胞在特定生理 ??或病理状态下表达的所有种类的蛋白质.人类基因 ??组计划完成后,从其功能及调节上解读人类基因组 ??是生命科学领域面临的最大挑战,基因及其产物的 ??高通量表达分析技术,正惊人的飞速发展….蛋白 ??质是基因的主要功能分子,也是医药工业重要的分 ??子靶标,对蛋白质组的研究因此受到巨大的关 ??注.蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或 ??病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行 ??分类和鉴定.传统的蛋白质研究注重研究单一蛋白 ??质,而蛋白质组学注重研究参与特定生理或病理状 ??态所有的蛋白质种类及其与周围环境的关系.蛋白 ??质组学研究方法及手段有多种,二维聚丙烯酰胺凝 ??胶电泳,质谱技术和生物信息学是蛋白质组学最常 ??用的三大技术. ??乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一,有很高 ??的发病率和死亡率.以二维聚丙烯酰胺凝胶电 ??泳(2一DE)为基础的蛋白质组学技术,在阐明乳腺 ??癌潜在的发生机制,寻找与诊断,治疗,预后,耐药等 ??有关分子靶标的研究中占有重要地位¨.在实 ??际研究工作中,由于所选样本的不同,蛋白质组学研 ??究主要是对某个亚组进行研究,是蛋白质组学研究 ??中的一个部分.目前常用的样本主要有乳腺癌组 ??织,细胞株,乳头吸出液,细胞间质及血清等¨, ??作者简介:邓世山(1972一),男,四川冕宁人,博士,讲师, ??主要从事乳腺癌蛋白质组学研究. ??收稿日期:2007—07—2O ??研究样本的选择确定了蛋白质组的研究范围,对某 ??一 ??样本的研究,是蛋白质组研究时实际工作的体现. ??本文对相关研究及结果进行回顾,以供今后在进一 ??步研究时参考. ??1蛋白质表达差异研究 ??乳腺癌是一种疾病状态,在其特定的病理状态 ??下所表达的蛋白质,无论在种类还是丰度上都与正 ??常乳腺之间有很大差异,这些差异不仅表现在乳腺 ??癌细胞与正常乳腺细胞之间,而且在二者的血清,乳 ??头吸出液,间质细胞等之间也有明显差异.蛋白质 ??是生物学功能的执行者,蛋白质表达差异决定乳腺 ??癌有特殊生物学行为,研究差异表达蛋白,一方面可 ??探讨乳腺癌的发生机制,另一方面可寻找与诊断,治 ??疗,预后等有关的生物学标记,这在乳腺癌研究中有 ??重要地位. ??1.1正常乳腺组织与乳腺癌组织:乳腺癌的发生 ??不仅由于细胞的恶性潜在性,其与细胞所处的微环 ??境也有很大的关系.正常乳腺组织成分复杂,除了 ??乳腺小叶及各级导管外,还有结缔组织,脂肪组织, ??血管等.探讨组织所有蛋白质的表达情况,包括细 ??胞内外的蛋白质表达差异,可以在较大范围内对癌 ??细胞直接或间接相关的蛋白质进行分析.LuoY ??等¨使用2一DE复合质谱分析浸润性导管癌与正 ??常乳