遗传学第十八章.pdfVIP

第18章 基因组学与后基因组学 主要讲授： 1 人类基因组计划与基因组学 2 基因组测序与序列组装 3 基因组图谱构建与应用 4 比较基因组学和功能基因组学研究 5 基因组的进化 18.1 人类基因组计划与基因组学 基因组学（genomics）： 它是研究基因组的组成、结构和功能的学科 结构基因组学（structural genomics）： 是着重研究基因组的结构并构建高分辨的遗传图、物理 图、序列图和转录图以及研究蛋白质组成与结构的学科； 功能基因组学（functional genomics） ： 主要是利用结构基因组学研究所得到的各种信息在基因 组水平上研究编码序列及非编码序列生物学功能的学科。 18. 1.1 人类基因组计划 美国能源部和国立卫生研究院（NIH）合作于1990年正 式启动人类基因组计划。主要目标是计划拨款30亿美元，用 15年时间完成人类基因组30亿bp全部序列的测定，在2001年 完成全部染色体的“工作草图”。 经过参加该项目的1000 多名各国科学家的通力合作，人 类基因组的工作草图于2000 年6月26日胜利绘制完成，该 工作草图包含人体90％以上碱基对的位置信息。 2000年6月26日，六国科学家公布人类基因组工作框架图 2001 年2月12日，人类基因组图谱及初步分析结果首次公布 2001 年8月26日，中国提前两年完成1％人类基因组测序任务 2003年4月15日，六个国家共同宣布人类基因组序列图完成 (美、英、德、日、法、中) 已经完成的人类基因组图谱(序列)来自不同人种的5个 个体，是一个参考图谱。 2004年10月，国际人类基因组测序联合体在Nature周 刊上发表了人类基因组常染色质全序列测定的论文 宣布人类基因组由31.647亿个碱基对组成，拥有编码蛋 白质的基因数目大约在2万到2.5万个之间。 18.1.2 人类基因组的结构特点 图18－1 人类基因组的组织组成 18.1.3 遗传标记 遗传学中曾将可识别的等位基因称为遗传标记（genetic marker） 。现代遗传学将可示踪染色体、染色体片段、基 因等传递轨迹的遗传特性也称为遗传标记。 1.形 态 标记： 是指那些能够明确显示遗传多态的外 形 态 标记 观性状，如株高、粒色等的相对差异 2.细胞学标记 ：是指能够明确显示遗传多态的细胞学特征。 细胞学标记 如染色体结构上和数量上的遗传多态性等。 3.蛋白质标记： 非酶蛋白质和酶蛋白质 在非酶蛋白质中，用得较多的是种子贮藏蛋白； 酶蛋白质主要是同功酶。 4.DNA 标 记： 也称DNA多态性标记、 DNA分子标记， 是 DNA水平上遗传多态性的直接反映。 这里仅介绍遗传的分子标记中的几种DNA分子标记: RFLP、VNTRs、AFLP、RAPD、SSR、STS和SNP （1） RFLP标记 (restriction fragment length polymorphism)： 同一物种的亚种、品系或个体间基因组DNA 受到同一种 限制性内切酶作用而形成不同的酶切图谱的现象，称为 限制性片段长度多态性 （RFLP)。 这是由于基因组DNA某一位点上的变异有可能引起该位点特 异性的限制性内切酶识别位点的改变，包括原有位点的消失或 出现新的酶切位点，致使酶切片段长度随之发生变化而产生。 对RFLP的检测主要是用Southern杂交的方法进行 基本流程： 组织或细胞→基因组DNA→限制性内切酶消化 →琼脂糖凝胶电泳→印迹转移至滤膜→预杂交 →加入探针→杂交→洗膜→放射自显影。 RFLP标记的主要特点是 ： （1）遍布于整个基因组，低拷贝序列； （2）无表型效应，不受发育阶段及器官特异性限制； （3）共显性，可区分纯合子和杂合子 ； （4）结果稳定、可靠；