太子参分解代谢关键酶8＇羟化酶基因的克隆及生物信息学分析.pdf

2016年7月l第41卷第13期 凰寞． 盎 Vo1．41，No．13lJuly，2016 太子参分解代谢关键酶 8羟化酶基因的 克隆及生物信息学分析 李军，龙登凯，周涛 ，丁铃，郑伟，江维克 (贵阳中医学院，贵州贵阳550002) [摘要] ABA8羟化酶是脱落酸 (abscisicacid，ABA)分解代谢中的关键酶基因之一。采用同源检索的方法从太子参转录组 数据库中获得7个 ABA8羟化酶 (abscisicacid8．hydroxylase)基因家族成员，对各家族成员进行转录分析组数据 以及ABA8 羟化酶关键基因ABA8oxl编码区(codingsequence，CDS)的克隆与生物信息学分析。ABA8oxl基因CDS全长 1401bp，编码 480个氨基酸残基，等电点为8．55，相对分子质量为53kDa，跨膜分析显示其为膜蛋 白，1—21个氨基酸残基位于胞内，22— 466个氨基酸残基位于胞外。转录组数据分析及定量PCR技术共同证 明ABA8oxl在块根的韧皮部及须根中有较高的表达。 多序列比对及聚类分析显示与其他植物CYP707A蛋白具有较高的同源性，且与模式植物拟南芥中ABA分解关键基因AtC· YP707A1和AtCYP707A3聚为一类。该研究为太子参块根膨大及对逆境胁迫响应的分子机制奠定基础。 [关键词] 太子参 ；脱落酸；降解 ；ABA8羟化酶；表达分析 Cloningandbioinformaticsanalysisofabscisicacid 8-hydroxylasefrom PseudostellariaeRadix LIJun，LONGDeng-kai，ZHOUTao ，DINGLing，ZHENGWei，JIANGWei-ke (GuiyangCollegeofTraditionalChineseMedicine，Guiyang550002，China) [Abstract] Abscisicacid8-hydroxylasewasoneofkeyenzymesgenesinthemetabolismofabseisicacid(ABA)．Sevenmenbersof abscisicacid8-hydroxylasewereidentifiedfromPseudostellariaheterophyllatranseriptomesequencingresultsbyusingsequencehomol— ogy．Theexpressionprofilesofthesegeneswereanalyzedbytranscriptomedata．ThecodingsequenceofABA8oxlwasclonedandana‘ lyzedbyinformationaltechnology．Th efull-lengthcDNA ofABA8oxlwas1401bp，with480encodedaminoacids．Thepredicatediso- electricpoint(pI)andrelativemolecularmass(MW)were8．55and53kDa，respectively．Transmembranestructurenaalysisshowed thattherewere21aminoacidsin—sideand445aminoacidsout—side．Highleveloftrna scriptscandetectinbrakofrootandfibrous root．Multi-alignmentna dphylogeneticanalysisbothshowthatABA8oxlhadahighsimilaritywiththeCYP707Asfrom otherplnats，es- peciallywithAtCYP707A1andAtCYP707A3inArabidopsisthaliana．Theseresultslayafoundationformolecularmechanism oftuber- OUSrootexpandingandresponset