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SOP-SC-051-01新鲜和冰冻组织DNA提取操作规程.PDF

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SOP-SC-051-01新鲜和冰冻组织DNA提取操作规程

最佳实践规范及标准操作流程文件汇编 V2.01 上海生物样本库 最佳实践规范及标准操作流程 文件汇编 (第二版) 2010年5月 最佳实践规范及标准操作流程文件汇编 V2.01 上海生物样本库 质量管理体系文件 文件名称 新鲜和冰冻组织DNA提取操作规程 编号 SOP-SC-051-01 批 准 人 批准日期 实施日期 新鲜和冰冻组织 DNA 提取操作规程 1.目的 规定从新鲜和冰冻组织中提取DNA实验应遵守的操作。 2.适用范围 使用与从新鲜和冰冻组织中提取DNA的操作。 3.定义和术语 3.1 DNA Deoxyribonucleic Acid 即脱氧核糖核苷酸,是遗传信息储存及传递者。 4.职责 4.1 样本库实验技术员负责从新鲜和冰冻组织中提取DNA。 5.设备和器材 见正文内容 6.正文 6.1 试剂准备 6.1.1所需试剂: 氯仿、EDTA、无水乙醇、70%乙醇、苯酚、1xPBS、蛋白酶K、TE缓冲液。 6.1.2 Tris-EDTA 1M Tris, pH 8.0, 20ml 0.5M EDTA, 20ml 无菌水 6.1.3蛋白酶K (20mg/ml) 将200mg蛋白酶K加入到10ml TE缓冲液,室温下放置20分钟。分装后-20 1 最佳实践规范及标准操作流程文件汇编 V2.01 ℃贮存。 6.2 组织样本研磨和裂解 6.2.1将组织置于盛有液氮的组织研磨器内,研磨将组织粉碎,或用Waring 搅拌器粉碎; 6.2.2 待液氮挥发,将组织粉末一点点加入10倍体积(m/V)裂解液的烧杯 中,分散在裂解液表面,振摇烧杯使粉末浸没。 6.2.3 使组织粉末完全分散于裂解液中后将悬液转移至15ml或50ml离心管 中,37℃温育1小时。 6.3 DNA 提取(酚-氯仿法) 6.3.1 将裂解液移至一个或多个适合离心机的离心管中,裂解液不能超过 1/3体积。 6.3.2 加入蛋白酶(20mg/ml)至终浓度100ug/ml。用玻棒温和将酶混入裂 解液中。 6.3.3 将裂解液置于50℃水浴中3小时,不时旋转溶液。 6.3.4 将溶液冷却至室温,加入等体积的 0.1M Tris.Cl (pH8.0)平衡过的 苯酚。将离心管缓慢颠转 10 分钟温和地混合两相。将离心管置于旋转器上 1 小 时。 6.3.5室温下5000g离心15分钟分离两相。 6.3.6将黏滞的水相(上层)转移至另一离心管。 6.3.7用苯酚在抽提两次,收集水相。 6.4 DNA分离 6.4.1第三次苯酚抽屉后,将水相转移至另一离心管中。加入0.2倍体积10M 醋酸氨及2倍体积乙醇,旋转离心管直至溶液彻底混匀。 6.4.2 DNA随即形成沉淀,在室温5000g离心5分钟收集沉淀。 6.4.3用70%乙醇洗涤DNA沉淀2次,在室温5000g离心5分钟收集沉淀。 6.4.4尽可能使用真空泵吸去残余的乙醇。于室温将DNA沉淀置于敞开的管 内,直至可见的痕量乙醇挥发殆尽。 6.4.5 加入 TE 缓冲液,将其置于摇床上,于 4℃温和振摇 12-24 小时直至 DNA完全溶解。

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