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流体力学相互作用对高分子过孔动力学行为的影响.pdf

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流体力学相互作用对高分子过孔动力学行为的影响

2013 年 10 月 12 日-16 日 2013 年全国高分子学术论文报告会 中国 上海 BP-033 流体力学相互作用对高分子过孔动力学行为的影响* 丁明明,卢宇源,石彤非,安立佳 中国科学院长春应用化学研究所高分子物理与化学国家重点实验室,长春 130022 随着 DNA, RNA 等生物大分子输运、测序和表征的快速进展,以及不同拓扑结构高分子 分离与提纯的需要,近年来高分子过孔行为的研究逐渐成为了高分子物理学,以及生物物理 学研究的焦点。在本工作中,我们采用格子玻尔兹曼(LB )与布朗动力学(BD )相结合的 计算机模拟方法,模拟了不同链长、不同流速下、考虑与不考虑流体力学相互作用时高分子 的过孔时间、临界流量和拉伸强度等过孔动力学行为。我们不仅证实了临界流量的存在,而 且发现:虽然流体力学相互作用对长链高分子的临界流量几乎没有影响;但是加快了其输运 进程,即,考虑流体力学相互作用下的标度指数要小于忽略流体力学相互作用下的标度指数, 这一研究结果澄清了以往文献中不同模拟方法模拟同一过孔过程获得不同标度指数的原因; 同时,我们还发现流体力学相互作用能够使得高分子链更紧凑。这些模拟结果为相关理论研 究奠定了分子基础,对相应的实验研究也有一定的促进作用。 关键词:高分子过孔,流体力学相互作用,临界流量 *国家自然科学基金重大国际(地区)合作研究(21120102037 )和国家重点基础研究发展规划 (2012CB821500 )资助 BP-034 分子拥挤效应及链刚性对受限条件下链分离的影响* 陈宇浩,罗开富 中国科学院软物质化学重点实验室,中国科学技术大学高分子科学与工程系,安徽合肥,230026 细菌繁殖过程中 DNA 向子细胞内的分离是一个重要的生物过程。近年来,强受限条件 下熵驱动的链分离作为 DNA 分离的一个重要模型得到广泛研究,然而实际细胞内的拥挤环 境和 DNA 链的刚性对 DNA 分离过程的影响还不清楚。我们通过朗之万动力学模拟的方法研 究了拥挤环境和分子链的刚性对受限条件下分子链分离的影响。结果表明,拥挤剂浓度的增 加加大了体系的粘度使得分子扩散减慢,导致链分离的减速。在对摩擦系数和分离距离进行 修正后,我们发现拥挤的环境反而加速了链分离。半柔性链在受限纳米管道内随着管径的增 加由 Odijk 区域向 de Genne 的区域转变,导致了分离时间的非单调行为。 关键词:拥挤效应,熵驱动力,染色体分离,链刚性,理论与模拟 *国家自然科学基金)资助 146

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