第四讲 SciFinder 相似结构检索 (Similarity Search).pdf

第四章 SciFinder 相似结构检索 (Similarity Search) 若用户的账号附有 SciFinder Substructure Module (SSM) 的功能，就能用以相似结构检索以下的物质。 ( ) 与已绘画的结构完全相同 跟第二章的完全相同结构检索相同 : , 包含检索结构的多元物质，例如 聚合物 配合物等 结构相似的物质，但元素成份、取代基和其位置有所不同 结构相似的物质，但只有少部分与检索结构互相符合 与检索结构相似，但有不同大小的环结构 检索的结果包括以下的数据。 物质基本数据 (如名称、结构、CAS 注册号) 实验物性和计算物性 摘要、相关参考和书目数据 供货商目录数据 物质管制和注册数据 物质的反应数据 (只适用于有 SSM 账号的用户) 用户可以用再检索(Refine) 的功能令检索的结果更加精确。而只有在以结构再检索相似结构结果后，才 能使用分析 (Analyze) 的功能。 预览 (Preview) 和 自动提示 (Keep me posted – 只适用于 SciFinder 的用户) 的功能不能在此使用。 3-1 相似结构检索简介 (Introduction of Similarity Search) 在相似结构的检索中， SciFinder 会用 Tanimoto 程序来检索与查询物质相似的结构，并给予相似 评分。 相似结构评分 相似检索能找出与查询结构最为相似的结构，其2-D 小分子的相似度会以Tanimoto 程序来计算。 以下是Tanimoto 的计算公式， 评分是以 CAS 的结构描述子为基本： 100 x C Tanimoto Score = (QS + FS) – C C = 代表检索结构和结果结构相同的描述子数目 QS = 代表在检索结构中的描述子数目 FS =代表在结果结构中的描述子数目 结构描述子的介绍 • 原子数 • 环数 • 原子排列 • 键排列 • 周边原子 • 相连原子数 • 元素成份 • 环类型 相似性的计算中并不考虑以下因素 氢原子的数目 离子 同位素标识 立体结构 多元物质的处理 每一个多元物质的成份，都会被给予相似评分 (Tanimoto score) 。 最高评分的成份 物质，将会在分析相似的结果中显 示。 3-2 用户检索单一物质时， 点击 Get Substance 后， 按下 Filter 中的 Structure components 即可。 3-3 注意事项 相似检索并不适用于 R 基团、可变的原子、重复单元和可变的取代位置工具。 分析和再检索不适用于相似结构检索。 在再检索结果时， 相似评分将不会显示。 相似评分不能以 sfr 形式保存 (只适用于 SciFinder) 。 不能使用预览功能。 相似评分的显示