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质粒小提提仿单
质粒小提实验步骤
这个操作方案可以从过夜培养的1.0-5.0 ml 培养物能得到5-30 μg 的高拷贝数的质粒或1-10 ug
低拷贝数的质粒DNA。如果需要提高低拷贝数质粒的产量,按下面的低拷贝数的方案。
1. 将带有目的质粒的E.coli 接种于裝有5 ml LB/氨苄青霉素的10-20ml 的培养管,37℃搖床培养12~16 h,以扩增质粒。用一个10-20ml 培养管或培养瓶,其体积至少有培养基的4 倍。建议使用endA 敏感型的E. coli 菌株来作常规质粒的分离,例如DH5α?和JM109?等菌株。
2. 取1.5~5.0 ml 的菌液,于室温下10,000 x g 离心1min 以沉淀菌种。
3. 倒出或吸出培养基,弃去。往沉淀中加入250 μlSolutionⅠ/RNaseA 混和液,漩涡振荡使细胞完全重新悬浮。细胞沉淀的完全重悬对于获得高的产量是十分重要的。
4. 往重悬混和液中加入250 μl Solution Ⅱ,轻轻颠倒混匀7-10 次。如有必要,可把裂解液置于室温静置2min,避免剧烈混和裂解液,否则会使染色体DNA 断裂而使得到的质粒纯度降低。裂解反应不要超过5min。(当使用完SolutionⅡ以后,须盖紧其瓶盖保存好,避免与空气中的CO2 反应。)
5. 往上述混和液中加入125 ul 冰浴Buffer N3,并温和地上下颠倒离心管数次混匀,直至形成白色絮狀沉淀。
6. 室温下,≥12000 x g 离心10min。
7. 小心将上清倒入干净的1.5ml 离心管中,加入0.1 倍体积的ETR 溶液(蓝色)至上清液中,颠倒试管7-10 次,然后于冰浴中静置10 min。
注意:在加入ETR 溶液后,裂解液可能出现浑浊,但冰浴后将逐渐转为澄清。
8. 将上述裂解液于42℃下静置5 min。裂解液又将再次出现浑浊。此时,立即于25℃ 12,000 x g 离心3min, ETR
9. 将上清液移至另一新的1.5 ml 离心管中,加入1/2 倍体积室温的无水乙醇,轻轻颠倒试管6-7 次,室温放置1-2 min。
10. 取一干净的HiBind Mini Columns(I)裝在一个2 ml 收集试管上(已备)。小心吸出上清,取700 ul 样品溶液将其转至于柱子內,于室温下10,000 x g 离心1min,使裂解液完全流过柱子。( HiBind DNA 柱子一次最多能装700ul 溶液)
11. 弃去收集管种的滤液,将剩余的样品溶液转移至柱子中,于室温下10,000xg 离心1min,使裂解液完全流过柱子,弃滤液。
12. 把柱子重新装在收集管中,加入500μlHBBuffer 柱子上,室温下10,000xg 离心1min洗涤柱子,确保除去残余的蛋白质以得到后面操作所需的高质量DNA。
13. 弃去收集液,加入700μl DNA Wash Buffer (用无水乙醇稀释的)洗涤柱子,室温10,000xg离心1min,弃去洗涤液。
注意:浓缩的DNA 洗涤缓冲液在使用之前必须按标签的提示用乙醇稀释。如果DNA 洗涤缓冲液在使用之前是置于冰箱中的,须将其拿出置于室温下。
14. 重复步骤13,再用700μl 的 DNA 洗涤缓冲液洗涤柱子一次。
15. 室温下最高速(≥13,000xg)离心空柱2min 以甩干柱子基质。
注意:不要忽略此步――这对从柱子上除去乙醇至关重要。
16. 把柱子置于一干净的1.5ml 小离心管上,直接加入30~50μl Elution Buffer(或无菌去离子水,或10mM Tris-HCl,pH8.5)到柱子基质上(所加的量取决于预期终产物浓度),室温下静置2min。≥13,000xg 离心1min 以洗脱出DNA。
这步可以洗脱70-85%的DNA,若进行第二次洗脱则可得到大部分残余的DNA,只是浓度较低。
低拷贝数质粒方案:
低拷贝数的质粒通常情况下从每毫升过夜培养的菌液中可得到0.1-1ug DNA。对于从低拷贝数质粒(0.1-1ug/ml 培养基)或低-中量拷贝数质粒(1-2ug/ml)细菌中分离质粒,如有需要,可以通过改良这方法来提高产量。
开始用10-15ml 菌液,15ml 离心管5000xg 离心10min。进行方案1 的第3 步,加入两倍体积的溶液Ⅰ、Ⅱ、N3、ETR Solution。用一个微量结合柱继续按照前面的操作进行,。不须要加大HB 和Wash Buffer 的用量。溶液Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ可以单独购买。
注意:这方法不适用于高拷贝数质粒,因为超过15ml 培养基,大量结合柱很快就会饱和。这种情况下,我们推荐把同一培养基里的样品分成多个样品处理。
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