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遗传学中的统计方法.pdf
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目录
第1章 群体遗传学中的基本概念与原理
§1.1 遗传学的基本概念与术语
§1.2 哈代-温伯格平衡定律
§1.3 亲属对基因型联合分布
1.3.1 父子对和兄弟对
1.3.2 适合于一般亲属对的ITO方法
§1.4 遗传方差与协方差
1.4.1 遗传方差的定义
1.4.2 遗传方差和协方差的一个经典推导方法
§1.5 连锁与连锁不平衡
1.5.1 连锁、重组和连锁分析
1.5.2 连锁不平衡与关联分析
习题一
第2章 定量性状的连锁研究
§2.1 LOD计分法
§2.2 Haseman-Elston线性回归方法
2.2.1 定量性状值对性状位点IBD值的回归方程
2.2.2 用于标记位点的连锁分析的回归方程
2.2.3 一个例子
§2.3 Risch-Zhang极值兄弟对方法
2.3.1 极值抽样方法
2.3.2 检验的功效
§2.4 统计软件
习题二
第3章 定性性状的连锁研究
§3.1 患病兄弟对方法
3.1.1 方法简介
3.1.2 给定兄弟对的患病状态下标记位点IBD值的条件分
布
3.1.3 检验方法
§3.2 患病亲属对方法
3.2.1 给定亲属对疾病位点IBD值下患病状态的分布
3.2.2 给定亲属对患病状态下标记位点IBD值的分布
3.2.3 若干检验方法及比较
§3.3 患病亲属对的LOD计分法
3.3.1 多态信息含量
3.3.2 检验方法的构造
3.3.3 检验的功效
3.3.4 期望最大LOD计分
§3.4 一个例子
§3.5 统计软件
习题三
第4章 关联分析
§4.1 基于群体数据的关联分析
4.1.1 皮尔逊x2检验
4.1.2 Armitage趋势检验
§4.2 传递不平衡检验(TDT检验)
4.2.1 匹配病例对照设计与McNemar检验
4.2.2 TDT检验过程与一个实际例子
4.2.3 TDT检验对群体分层的稳健性
§4.3 群体分层与关联分析
4.3.1 群体分层与哈代-温伯格平衡定律
4.3.2 群体分层和不同种族通婚对关联分析的影响
§4.4 统计软件
习题四
第5章 基于家庭病例对照设计的关联分析
§5.1 应用于DNA混合的家庭病例对照设计
5.1.1 方法概述
5.1.2 包括若干个有病的小孩和他们的父母亲的家庭结构设
计
5.1.3 同时包括有病的和正常的兄弟姊妹,但没有父母亲的
家庭结构设计
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