《生物计算技术》第4章 多重序列比对分析-2006.pptxVIP

Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 第4章 多重序列比对分析 目的要求： 1 掌握多重序列比对的基本概念及意义。 2 掌握多重序列比对的星形比对、树形比对及隐马尔可夫模型。 3 了解多重序列比对的动态规划算法、CLUSTAL W 算法。 教学内容： 4.1 多重序列比对的意义 4.2 多重序列比对算法原理 Multiple sequence alignment 4.1 多重序列比对的意义 目的： 发现多个序列的共性 发现与结构和功能相关的保守序列片段 定义： 设：有k个序列s1, s2, ... ,sk，每个序列由同一个字母表中的字符组成，k大于2，通过插入“空位”操作，使得各序列达到一样的长度，从而形成这些序列的多重比对。 Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 8条免疫球蛋白序列片段的多重比对： 半光氨酸 色氨酸 疏水残基 保守区域 SP得分 Biocomputing technology— Multiple sequence alignment Biocomputing technology— Multiple sequence alignment 通过序列的多重比对，可以得到一个序列家族的序列 特征。