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羽绒再生候选基因SNPs及其与皖西白鹅羽绒性状的关联分析论文
摘要
皖西白鹅是我国优良地方鹅种,羽绒产量和品质是其重要的遗传优势性状。
BMP 家族在调控羽绒生长发育的信号通路中主要起抑制作用,其成员 BMP2 是毛
囊及羽毛发生的重要调节基因。BMPR1A 作为 BMP 的受体,与角蛋白合成有关,
具有调控出生后毛囊分化和增生的功能。ACTB 是构成细胞骨架肌动蛋白的一种,
且在皖西白鹅换羽后呈显著上调表达。本试验以 BMP2 、BMPR1A 和 ACTB 基因作
为影响羽绒性状的候选基因,研究分析基因多态性及其与羽绒性状的相关性。研究
结果为进一步了解皖西白鹅羽绒性状的遗传特征,及培育专门化绒用品系提供理论
依据。
基因多态性分析结果表明,BMP2 基因所检测的两处片段均未呈现多态性。
BMPR1A 基因在其 mRNA 序列的 1182bp 处存在 A-T 突变,突变位点处于 Exon 8
上,导致 3 联密码子 ACT-TCT (苏氨酸-丝氨酸)突变;群体分为 CC、DD 和 CD
三种基因型,基因型频率分别为 0.2174、0.2880 和 0.4946 。ACTB 基因在其 mRNA
序列的 968bp 处存在G-A 突变,突变位点处于Exon 4 上,导致3 联密码子 GGG-GAG
(甘氨酸-谷氨酸)突变;群体分为 EE 、FF 和 EF 三种基因型,基因型频率分别为
0.2192、0.2945 和 0.4863 。群体在两基因的突变位点上均处于Hardy-Weinberg 平衡
状态。BMPR1A 和 ACTB 基因的群体杂合度分别为 0.4975 和 0.4972,有效等位基
因数分别为 1.99 和 1.9889,多态信息含量分别为 0.4356 和 0.4354,处于中度多态
(0.25<PIC <0. 5 ),遗传变异度较高。
皖西白鹅于 110 日龄换羽期时,活体取羽并分别保存羽毛和羽绒。其平均重量
分 别 为 79.39±15.03g/ 只 和 64.68±10.18g/ 只 ; 分 别 测 定 了 羽 绒 的 蓬 松 度
(13.68±1.16cm)、残脂率(1.40%±0.98%)、耗氧量(32.54±21.59mg/100g )、绒朵
长(30.50±4.94mm )、千朵重(2.61±0.49g )。取羽后,观察羽绒再生情况,取羽后
第 7 天和 14 天时统计鹅左侧胸部 2cm×2cm 范围内的再生绒朵的数目,分别达到
2 2
3.82±3.07 个/cm 和 6.62±1.11 个/cm 。
基因型与羽绒性状关联分析表明,BMPR1A 基因 CC 基因型残脂率明显高于
DD 型,取羽 1 周后再生绒朵数低于 DD 型,绒朵长表现为杂合 CD 型显著高于 DD
型和 CC 型(p0.05 ),其余各项指标间差异不显著;ACTB 基因 FF 型蓬松度高于
EE 型,杂合 EF 型取羽 1 周后再生绒朵数及千朵重均高于 FF 和 EE 型,其余各项
指标间差异不显著;ACTB 基因和 BMPR1A 基因合并基因型分析显示,羽绒蓬松
度指标表现为 CCFFCDEE、CCFFDDEE、CCFFCCEF (p0.05 ),综合考虑取羽
2 周后再生绒朵数、千朵重及绒朵长等指标,CDEF 基因型均显著优于 CDFF、DDEE 、
DDFF 和 CCEF 等基因型,其余各项指标间差异不显著。
关键词:皖西白鹅,BMPR1A ,ACTB ,BMP ,羽绒性状
I
Abstract
As a Chinese indigenous breed, Wanxi white goose is famous for its downy traits, and
genetic play important role during this economically important traits formation. BMP
family, negatively regulate follicle morphogenesis,
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