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第25卷第11期 计算机应用研究 V01．25No．11
Researchof NOV．2008
2008年11月 Application Computers
DNA编码问题及其复杂性研究
张凯，耿修堂，肖建华，张勋才
(华中科技大学控制科学与工程系，武汉430074)
摘要：’高质量的DNA编码可以避免DNA分子间的非特异性杂交，提高DNA计算的有效性和可靠性。首先
对DNA编码的约束条件进行归类，分析了各编码约束对编码质量的影响；然后研究了编码质量、编码数量、序列
长度与DNA计算可靠性、有效性、可扩充性之间的关系；最后通过类比DNA编码问题和图的独立集问题，说明
了求解最大DNA序列集合问题是NP完全的。
关键词：DNA计算；DNA编码设计；组合优化
中图分类号：TP301．5 文献标志码：A 文章编号：1001-3695(2008)11—3264-04
DNA and
designproblemcomplexityanalysis
sequence
ZHANG Xun-cai
Kai，GENGXiu—tang，XIAOJian·hua，ZHANG
430074，China)
(Dept．ofControlScienceEngineering，HuazhongUniversityofScience＆Technology，Wuhan
can theinterferencebetweendifferentDNA therelia-
DNA molecules，and
Abstract：Highqualitysequencesprevent improve
DNA theiniluenceofconstraintson
andeffectivenessofDNA first，classifiedconstraints，and
bility computation．At analyzed
DNA the studiedthe betweenDNA andthe ofDNAeom-
the of efficiency
quMity sequences．Thenpaper relationship sequence
carriedonthe toDNA and set
analogy design graphindependentproblem，and
puting．Finally，thepaper sequenceproblem
themaximumDNA set wasaNP problem．
proved sequencesproblem complete
Keywords：DNA design；combinatorialoptimization
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