系统发育基因组学通向整合生物学的入口.PDFVIP

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2017-06-11 发布于天津
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系统发育基因组学通向整合生物学的入口

系统发育基因组学：通向整合生物学的入口谢强 qiangxie@ 系统发育基因组学Phylogenomics简史 • 名词创造 • 1998, 1999 • 依托系统发育讨论基因组进化 • 染色体水平倒位、重排、缺失… • 基因族和基因超族的形成历史 • 水平/横向基因转移(HGT/LGT) • 含义扩展 • ~2004 • 基于大数据的系统发育推断 Eisen JA. 1998. Genome Res. 8: 163–167. O’Brien SJ, Stanyon R. 1999. Nature 402: 365–366. 整合生物学Integrative biology简史 • 名词创造 • ~1998, 1999 • 发展现状 • 生理（广义）↔生态 • 微进化 Pennisi E. 1998. Science 279: 807-809. Trumbo ST. 1999. Trends Ecol. Evol. 14: 5–6. 生理、生态、进化之间的学科交叉 Physio- Mechanism in vivo Species D P i o v l e y r m s i o t y r p h i s m 为什么说Phylogenomics是通向整合生物学的入口最终建立可信的系统发育 ↙ ↘ 更为可靠的分歧时间推断形态和分子衍征的分析 ↘ ↙ 特定类群及相应衍征分异的古生态背景是什么 ↓ 建立假设 ↓ 以生理-生态学研究中的双向遗传学研究范式检验假设什么是分子衍征及其意义