丁酸钠诱导Raji细胞基因表达的变化论文.docVIP

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丁酸钠诱导Raji细胞基因表达的变化论文.doc

  丁酸钠诱导Raji细胞基因表达的变化论文 张海涛 伍俊 汪亚君 郭黠 冯哲玲 梁念慈 朱振宇 马涧泉 【摘要】 目的分析丁酸钠诱导Raji细胞的基因表达变化,探讨丁酸钠诱导凋亡作用机制。方法限制性显示PCR技术(Restriction Display PCR,RDPCR)分析基因表达变化,利用互联网提供的GenBank核酸数据库分析比对获得的差异表达序列。结果获得14条差异表达序列,其中6条是对照组高表达序列,8条是实验组高表达序列。结论采用RDPCR技术可以快速简便地分析药物诱导基因表达变化。分析表达差异的序列发现,丁酸钠可诱导促进细胞凋亡的基因表达,降低肿瘤细胞高表达的基因表达。 【关键词】 限制性显示PCR技术;丁酸钠;凋亡;基因表达 Change of Gene Expression in Raji Cells Induced by Sodium Butyrate Abstract:Objective This study echanism of apoptosis induced by sodium butyrate. MethodsThe change of gene expression butyrate. ConclusionThe change of gene expression induced by drugs could be analyzed by RDPCR methods quickly and simply. Gene expression that prompted cell apoptosis butyrate or cells butyrate; Apoptosis; Gene expression 0引言 Raji细胞是悬浮状态生长的,但我们前期研究发现Raji细胞在丁酸钠的处理下可由悬浮生长状态转变为贴壁生长状态,伴随有细胞凋亡现象的发生1。我们研究小组拟通过RDPCR显示mRNA表达差异来揭示丁酸钠诱导Raji细胞凋亡时基因表达的变化,试图寻找造成细胞发生形态学变化的主要基因,探讨丁酸钠作用的可能机制。 1材料和方法 1.1主要试剂丁酸钠(SB), 溴化乙锭(Sigma公司); DNA回收试剂盒(QIA quick Gel Extraction Kit Protocol, 德国QIAGEN公司); mRNA纯化试剂盒(Omega Biotek公司), 限制性内切酶Sau3AI, DNA连接试剂盒, LA Tag酶, RNasin, T4 DNA 连接酶, dNTP, PMD18T Vector, JM109细菌(大连宝生物公司); 丙烯酰胺, N, N’–甲叉双丙烯酰胺, 琼脂粉, 琼脂糖, Tag酶, 低熔点琼脂糖(上海生物工程公司); 胰蛋白胨, 酵母提取物(英国OXIOD公司); Tris饱和酚(鼎国生物工程公司); 逆转录酶, TRIzol试剂, DEPC(Invitrogen公司); RPMI1640(Gibco公司); 小牛血清(杭州四季青公司); 100bp DNA Ladder(Bebco公司); 氯仿, 异丙醇(国产分析纯)。 1.2细胞培养Raji细胞株(来源于中山大学肿瘤防治中心)以含10%小牛血清的RPMI1640培养液于5% CO2中培养。 1.3细胞mRNA的提取将生长状况良好的Raji细胞接种在6孔培养板中,细胞浓度为1.0×106/ml,加入3mmol/L丁酸钠,37℃、5% CO2培养。总RNA的提取按照Invitrogen公司提供的TRIzol试剂说明书进行操作。最后加30μl DEPC处理水溶解总RNA。参照mRNA纯化试剂盒说明书(Omega Biotek公司)操作,从总RNA中纯化mRNA。 1.4从mRNA反转录成为cDNA及双链cDNA末端平滑化 逆转录按照Invitrogen公司的说明书进行逆转录,mRNA约2μg,dNTP 0.5mmol/L,Oligd T15 0.1μmol/L,65℃,5min,加MMLV 200U和酶反应缓冲液,37℃延伸时间75min。cDNA样品20μl,70℃,10min。加入5μl T4 DNA Polymerase, 5μl 10×T4 DNA Polymerase Buffer,5μl 0.1% BSA,3.5μl 2.5mmol/L dNTP,12.5μl灭菌水,轻柔混匀。37℃反应5min。加入25μl EDTA(pH 8.0) 和25μl 10%的SDS,轻柔混匀,停止反应。加入100μl酚/氯仿溶液,振荡,混匀。10000g离心1min,液相分离,将上层水相转移至另一微量离心管中。加入1/10体积3mol/L NaAc(pH 5.2)、2.5

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