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【2017年整理】从DN与A到RNA转录
第三章 从DNA到RNA---转录;RNA 的转录;RNA的转录:transcription
酶:转录是一种酶促的核苷酸聚合过程,所需的酶叫做依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP)
编码链(有义链coding strand ):与mRNA序列相同的那条DNA链
反义链(无意义链,负链,antisense ):在RNA的转录中,用作模板的DNA链
增强子:Enhencer
启动子:Promoter
终止子:Terminator
转录单元:
转录区:;上游:Upstream
下游:Downstream
初级转录本:Primary transcript;二、转录的基本过程;酶对启动子的识别是转录的第一步
大肠杆菌启动子:在转录开始位置的上游10个和35个核苷酸位置有两段DNA的序列比较保守,分别称为-10序列(-10 sequence)和-35序列(-35 sequence)。;转录起始位点、-10区、-35区、-10区与-35区之间的间隔。
原核基因转录起始位点通常是嘌呤,其序列为CAT(A为起始位点)。
-10区是一个6碱基保守序列(常以-10为中心)。
-35区是另一个6碱基保守序列(常以-35为中心)
当-10区和-35区中心位置相距16-18bp时,该启动子的功能较强;相距较近或较远时,起始转录的功能都相应减弱。 ;全酶由5个亚基组成,去掉δ亚基的部分称为核心酶,核心酶本身就能催化苷酸间磷酸二酸键形成。利福平和利福霉素能结合在β亚基上而对此酶发生强烈的抑制作用。β亚基似乎是酶和核苷酸底物结合的部位。δ亚基的功能是辨认转录起始点的。β’亚基是酶与DNA模板结合的主要成分。α亚基可能与转录基因的类型和种类有关。 ;大肠杆菌RNA聚合酶
亚单位 分子量 亚单位数 组分 功 能
α 36512 2 核心酶 决定哪种基因被转录
核心酶组装
β 150618 1 核心酶 与转录全过程有关
形成活性中心
β 155613 1 核心酶 结合DNA模板
δ 70263 1 δ因子 识别不同的启动子
;启动子选择:RNA聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭复合物
开放复合物形成: δ亚基与-10区紧密结合,确认转录起始点,DNA解链形成开放复合物
开放复合物与最初的两个NTP结合并在这两个核甘酸之间形成磷酸二酯键后转变成包括RNA聚合酶、DNA、新生RNA的三元复合物
;8-14亚基
种类 分布 合成的RNA类型 对α-鹅膏蕈碱的敏感性
Ⅰ 核仁 rRNA 不敏感
Ⅱ 核质 hnRNA 低浓度敏感
Ⅲ 核质 tRNA,5sRNA 高浓度敏感
Mt 线粒体 单亚基,与T7类似 不敏感
Ct 叶绿体 多亚基,与细菌类似 不敏感
;模板的识别-真核;
;转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生:酶与启动子结合后,并在RNA聚合酶(?)的催化下使DNA的双链解离,形成转录泡,为RNA合成提供单链模板,并按碱基配对原则,结合核苷酸,在核苷酸之间形成磷酸二脂键(起始复合物)。
转录起始后直到形成9个核苷酸短链,是通过启动子阶段,此时RNA聚合酶一直处于启动子区,新生的RNA链与DNA链的结合不够牢固,很容易从DNA链上掉下来并导致转录重新开始。一旦RNA酶成功地合成9个以上核苷酸并离开启动子区,转录就进入正常的延伸阶段。所以,通过启动子的时间代表一个启动子的强弱。一般来说,通过启动子的时间越短,该基因转录起始的频率也越高。
当RNA链伸长到8~9个核酸后, δ亚基解离,起始完成,进入RNA的延伸阶段 .; ;转录的延长阶段,原核生物与真核生物之间没有太大差别。 ;4、转录的终止;两类终止信号有共同的序列特征,在转录终止之前有一段回文结构,之间由几个碱基隔开.
不依赖ρ因子的终止序列中富含G·C碱基对,其下游6-8个A;
依赖ρ因子的终止序列中G·C碱基对含量较少,其下游也没有因固定的特
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