SSR分子标记分析.pptVIP

SSR标记 —崔朝宇 SSR标记的简介及原理 SSR标记的步骤及分析 SSR标记引物设计 SSR标记 1 2 3 SSR （simple sequence repeat） SSR标记 简单重复序列（Simple Sequence Repeat，SSR），指的是基因组中由1-6个核苷酸组成的基本单位重复多次构成的一段DNA，广泛分布于基因组的不同位置，长度一般在200 bp以下 SSR标记是一种通过直接分析遗传物质的多态性来鉴别生物内在的核苷酸排布及其外在状态表现规律的技术 SSR标记的简介 SSR分子标记的分子学基础 微卫星在真核生物的基因组中的含量非常丰富，而且常常是随机分布于核DNA中。在植物中通过对拟南芥、玉米、水稻、小麦等的研究表明微卫星在植物中也很丰富，均匀分布于整个植物基因组中，但不同植物中微卫星出现的频率变化是非常大的 常见的二核苷酸重复单位：（AC)n、（GA)n、（AT)n 常见的三核苷酸重复单位： （AAG)n、（AAT)n SSR分子标记的分子学基础 微卫星中重复单位的数目存在高度变异，这些变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相同，因而造成多个位点的多态性。如果能够将这些变异揭示出来，就能发现不同的SSR在不同的种甚至不同个体间的多态性，基于这一想法，人们发展了SSR标记 SSR分