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蛋白质(仅供参考)
Protein:蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。
肽(peptide):是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。
氨基酸等电点 (isoelectric point, pI): 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
Primary structure of protein:多肽链中氨基酸的排列顺序,包括氨基酸的种类、数目、排列顺序以及二硫键的位置。
一级结构与功能:
(1)蛋白质分子的一级结构是形成空间结构的基础,其生物学功能是由蛋白质分子特定的天然空间构象所决定的
(2)一级结构中关键氨基酸残基的改变会影响蛋白质的功能,所以一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。
(3)一级结构相似的多肽或蛋白质,空间构象及功能也相似
蛋白质的二级结构(secondary structure:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置(并不涉及氨基酸残基侧链的构象) 。
蛋白质的三级结构(tertiary structure ):整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。
蛋白质的四级结构(quaternary structure ):蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。
肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。
a-螺旋 (a-helix):多肽链的主链围绕中心轴上升,呈有规律的右手螺旋,是一种常见的较为稳定、也较为致密的二级结构。其中螺旋3.6氨基酸/圈、螺距0.54nm,由氢键稳定螺旋。
b-片层 (b- pleated sheet):两条或两条以上的肽段平行或反向平行排列,依次折叠成锯齿状,肽链间形成氢键,与折叠长轴基本 垂直,稳固b-片层,是肽链较为延展和松弛的结构。
模体(motif):又叫模序、基序、基元。 是蛋白质分子空间结构中两个或两个以上有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,是具有特殊功能的超二级结构。
结构域(domain):大分子蛋白质的三级结构常可被分割折叠成多个较为紧密的区域,并各行使其功能,称为结构域(domain) 。
蛋白质的变性(denaturation):在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。变性的本质是破坏非共价键和二硫键,不改变多肽链的氨基酸序列。
变性、沉淀和凝固的关系:
变性蛋白质不一定沉淀;沉淀蛋白质不一定变性;沉淀蛋白质也不一定凝固;但凝固的蛋白质一定已变性,且为不可逆变性
蛋白质胶体稳定的因素:颗粒表面电荷 、水化膜。
核酸
核酸(nucleic acid) 是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。
核酸的一级结构:核酸中核苷酸从5末端到3末端的排列顺序。
deoxyribonucleic acid(脱氧核糖核酸)
double helix –双螺旋结构:DNA是反向平行、右手螺旋的双链结构 DNA双链之间形成了互补碱基对,疏水作用力和氢键共同维持DNA。
Genome(基因组):指单倍体细胞核、细胞器或病毒粒子所含的全部DNA分子或RNA分子。
真核生物染色体由DNA和蛋白质构成,其基本单位是 核小体(nucleosome)。
DNA变性:在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。不改变其核苷酸序列。
DNA复性(renaturation)的定义:在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。
核酶:某些小RNA分子具有催化特定RNA降解的活性,这种具有催化作用的小RNA亦被称为核酶(ribozyme)或催化性RNA(catalytic RNA)。
核酸酶是指所有可以水解核酸的酶(本质为蛋白质)
核酸分子杂交(hybridization) :不同来源的DNA单链分子或RNA分子如果存在着一定程度的碱基配对关系,在适宜的条件,可以在不同的分子间形成杂化双链(heteroduplex)的过程。
酶
酶(enzyme ,E):是由活细胞合成的、对其特异底物(substrate ,S)起高效催化作用的蛋白质,是机体内催化各种代谢反应最主要的催化剂。
多功能酶(串联酶): 由一条多肽链组成的,具有多种不同功能的酶。
辅酶(coenzyme):非蛋白质成分(小分子有机化合物), 参与酶催化过程中电子、质子或基团传递, 分子结构中常含有维生素类物质, 通
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