第6章生化(刘建华)精品.pptVIP

图6.16 内部重复的序列比对。（A）TATA box结合蛋白的两个重复进行的序列比对。N-端重复用绿色表示，C-端重复用蓝色表示。(B) TATA-box结合蛋白的结构。N-端绿色，C-端蓝色。 同一进化是解决生化挑战的共同方法 同一祖先蛋白分子，产生有差异的蛋白叫差异进化。而不同祖先分子产生结构类似的蛋白质，执行相似的生化功能，叫同一进化。 同一进化的例子之一是能够水解肽键的丝氨酸蛋白酶。这些酶的活性位点的结构很相似，其组氨酸、丝氨酸和天冬氨酸在空间的排布几乎一致。这些蛋白酶水解肽键的机理完全相同。初看起来，这种相似性似乎意味着这两种蛋白质是同源物，来自同一祖先分子。但是这两种蛋白质的空间结构差异显著，因此不可能有共同祖先（图6.18）。 图6.17 蛋白酶活性位点的同一进化。丝氨酸类蛋白酶胰凝乳蛋白酶和枯草杆菌蛋白酶的活性位点的三个关键残基位置几乎一致。 图6.18 胰凝乳蛋白酶和枯草杆菌蛋白酶的结构。与活性位点空间结构（在蛋白质空间结构顶部）高度相似性不同，枯草杆菌蛋白酶和胰凝乳蛋白酶的空间结构差异显著。b-链用黄色表示，a-螺旋用蓝色表示。 RNA序列比较能够了解RNA二级结构 同源RNA序列也可以用前面介绍的方法比较。这种比较既能研究RNA进化，又能为RNA分子自身的三维结构提供思路。 单链核酸能折