36 份枣品种SSR 指纹图谱的构建.pdfVIP

园 艺 学 报 2012 ，39 （4 ）：647 –654 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 36 份枣品种 SSR 指纹图谱的构建 1 2 1 1 1 1,* 麻丽颖 ，孔德仓 ，刘华波 ，王斯琪 ，李颖岳 ，庞晓明 1 （北京林业大学计算生物学中心，林木育种国家工程实验室，林木、花卉遗传育种教育部重点实验室，北京 100083 ； 2 河北省沧县枣树国家良种基地，河北沧州 061000 ） 摘 要：利用 12 对 SSR 引物对 36 个枣品种进行分析，采用荧光 M13 毛细管电泳技术进行多态检测， 共检测到 99 个多态位点，每对引物的多态位点数达到 8.25，PIC 值变幅为 0.62 ~ 0.85，平均为 0.75 。依 据 12 对 SSR 引物在 36 个品种中扩增的特异带型组合，采用引物—带型组合法构建了 36 个枣品种的指纹 图谱，并对这 36 份枣品种做聚类分析，遗传相似系数在 0.6667 ~ 0.9444 之间。研究结果为枣树分类、种 质鉴定和分子育种提供了重要的工具。 关键词：枣；SSR；指纹图谱；毛细管电泳；遗传相似性 中图分类号：S 665.1 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2012 ）04-0647-08 Construction of SSR Fingerprint on 36 Chinese Jujube Cultivars 1 2 1 1 1 1,* MA Li-ying ，KONG De-cang ，LIU Hua-bo ，WANG Si-qi ，LI Ying-yue ，and PANG Xiao-ming 1 （Center for Computational Biology，National Engineering Laboratory for Tree Breeding ，Key Laboratory of Genetics and Breeding in Forest Trees and Ornamental Plants ，Ministry of Education ，Beijing Forestry University ，Beijing 100083 ， 2 China； National Improved Cultivar Station of Jujube ，Cangzhou，Hebei 061000，China） Abstract ：In this study，36 Chinese jujube cultivars were analyzed by capillary electrophoresis using fluorescent M13 multi-state detection method with 12 pairs of newly developed SSR primers. Totally，99 polymorphic alleles were revealed ，with an average of 8.25 for each primer pairs. Polymorphism information content values for the primer pairs ranged from 0.62 –0.85，with an average of 0.75. A strategy of combining primer pair with distinct alleles for fingerprint construction was