辣椒EST-SSRs+的分布特征及在品种多样性研究中的应用.pdfVIP

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2017-06-13 发布于山东
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辣椒EST-SSRs+的分布特征及在品种多样性研究中的应用.pdf

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园艺学报 2013 ，40 （2 ）：265 –274 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 辣椒 EST-SSRs 的分布特征及在品种多样性研究中的应用 1 2 2 1 1 1,* 1,* 魏兵强，刘飞云，马宗桓，陈灵芝，张茹，王兰兰，侯栋 1 2 （甘肃省农业科学院蔬菜研究所，兰州 730070 ；甘肃农业大学农学院，兰州 730070 ）摘要：为开发高效实用的 EST-SSRs 标记，从 120 605 条辣椒无冗余 EST 序列中共搜索到 10 179 条至少含有 1 个 SSR 的EST 序列，占 EST 总数的 8.44%。高频重复类型为一核苷酸、二核苷酸和三核苷酸，占EST-SSRs 总数的91.63% 。最常见的基元是A/T ，其次是TC/GA 和CT/AG 。设计合成了20 对EST-SSRs 引物并对 25 份辣椒材料进行了 PCR 扩增，结果表明：17 对引物在供试辣椒材料中能扩增出明显的条带，其中 12 对引物扩增出 42 条多态性条带，平均多态性条带为 3.5 条，引物的多态性信息含量介于 0.21 ~ 0.95 之间。利用 EST-SSRs 标记对供试品种的聚类分析结果与形态学、生物学分类结果基本一致，表明本研究中开发的EST-SSRs 标记可用于辣椒种质资源的遗传多样性分析。关键词：辣椒；EST-SSR ；分子标记；遗传多样性中图分类号：S 641.3 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2013 ）02-0265-10 Distribution Characteristics of EST-SSRs and Their Application on Varieties Genetic Diversity Analysis in Pepper 1 2 2 1 1 1,* WEI Bing-qiang ，LIU Fei-yun ，MA Zong-huan ，CHEN Ling-zhi ，ZHANG Ru ，WANG Lan-lan ， and HOU Dong1,* 1 2 （Vegetable Institute，Gansu Academy of Agricultural Sciences，Lanzhou 730070 ，China；College of Agronomy，Gansu Agriculture University ，Lanzhou 730070 ，China ） Abstract ：To develop efficient and practical EST-SSRs markers，10 179 EST sequences each of which contained at least one SSR were obtained from