利用抑制差减杂交技术分离茄子单性结实相关ESTs.pdfVIP

园 艺 学 报 2010 ，37 （12）：1944 –1952 Acta Horticulturae Sinica 利用抑制差减杂交技术分离茄子单性结实相关 ESTs 1 1 1,* 1,2 1 周亚君 ，陈钰辉 ，刘富中 ，张 映 ，连 勇 1 2 （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081 ； 中国农业大学农学与生物技术学院，北京 100193 ） 摘 要：以茄子（Solanum melongena ）单性结实品系D-10 和非单性结实品系 03-2 的子房 cDNA 分 别为试验组（Tester ）和驱动组（Driver ），利用抑制差减杂交（SSH ）技术构建了正反两个 SSH-cDNA 文 库，分别包含 472 和 124 个克隆。通过测序、序列拼接后，共获得 384 个 Unique ESTs 。将其与非冗余蛋 白数据库进行BLASTx 比对，在E 值小于等于 1e-10 条件下，有 257 个 ESTs 能找到相匹配的蛋白质，其 中 121 个 ESTs 与非冗余蛋白质数据库中已知功能的蛋白质具有高度的相似性。功能注释结果表明，具生 物过程、分子功能和细胞组分的 EST 分别为 107、102 和 119 条。推测与单性结实相关的 EST 有 5 条：2 条 ESTs 属于 MADS-box 转录因子家族，1 条与生长素增长蛋白同源，1 条属于 P450 还原酶系，1 条属于 MAPKK 家族；另外 136 个 ESTs 代表了未知功能基因。 关键词：茄子；单性结实；抑制差减杂交 中图分类号：S 641.1 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2010 ）12-1944-09 Isolation of Parthenocarpy Related ESTs in Parthenocarpic Eggplant Using Suppression Subtraction Hybridization （SSH ） 1 1 1,* 1,2 1 ZHOU Ya-jun ，CHEN Yu-hui ，LIU Fu-zhong ，ZHANG Ying ，and LIAN Yong 1 2 （Institute of Vegetables Flowers ，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Beijing 100081，China； College of Agronomy and Biotechnology ，China Agricultural University，Beijing 100193，China ） Abstract ：A forward and a reverse suppression subtraction hybridization （SSH）cDNA library with 472 and 124 positive clones were constructed respectively with cDNA from eggplant （Solanum melongena ）parthenocarpic line D-10 ovary as the tester and cDNA from un-parthenocarpic line 03-2 ovary as the driver. After removing repeat and redundancy sequences，384 expressed sequ