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ProceedingsoftheWorkshopon 海南生物技术研究
ResearchDevelopmentofBiotechnology 与发展研讨会论文集
inHainan,31July-1August,2006,Sanya,China 2006年7月31日一8月1日,中国,三亚
水稻QTL克隆研究进展
吴海滨’“赵德刚2李迪,.
海南省热带农业资源开发利用研究所,三亚,572025;2贵州大学生命科学学院,贵阳,550025
通讯作者,lidi@hitar.org
摘 要 随着分子标记和基因定位技术的高速发展,采用图位克隆的方法克隆控制数量性状的单个
基因位点己成为可能。本文主要介绍了几种QTL位点— 控制抽穗期的主效基因Hdl、与水稻抽穗
期有关的Hd6.Hd3a、与水稻产量相关的Gnl、与水稻耐盐相关的SKCI的研究现状,这些研究为阐明
作物重要性状的遗传控制机理以及育种改良提供理论基础。
关健词 水稻,QTL,图位克隆
RecentProgressofQTLCloninginRice
WuHaibin2,ZhaoDegang2LiDi*
1Rain- InstituteofTropicalAgricul lResources,Sanya,
572025;2LifeScienceDepartmentofGuizhouUniversity,Guiyang,550025
*Correspondingauthor,lidi@hitar.org
AbstractItisbecomingpossibletoclonesinglelocusofQTLusingmap-basedcloningmethodsfollow-
ingtherapiddevelopernentofmolecularmarkersandgenepositioningmethods.Theresearchprogressof
severalQTLloci,suchasmajorgeneHdlcontrollingtheheadingdate,theheadingdaterelatedgenesHd6,
Hd3a,协eldrelatedgeneGnlandSalttolerantrelatedgeneSKCI.Theseprogresseswillbuildthetheoretic
foundationforillustratingthegeneticmechanismofimportanttraitsandforbreedingpractice.
KeywordsRice,QTL,Map-basedcloning
随着分子标记和基因定位技术的高速发展,采用图位克隆的方法克隆控制数量性状的单个基因
位点己成为可能。理论研究表明,影响QTL初步定位灵敏度和精确度的最重要因素还是群体的大小。
但是,在实际研究中,限于费用和工作量,所用的初级群体不可能很大。而即使没有费用和工作量的问
题,一个很大的群体也会给田间试验的具体操作和误差控制带来极大的困难。为了精细定位某个QTL,
必须使用含有该目标QTL的染色体片段代换系或近等基因系(简称为目标代换系)与受体亲本进行杂
交,建立次级实验群体,将QTL分解为单个孟德尔因子。一个理想的染色体片段代换系应该是,除了目
标QTL所在的染色体片段完整地来自供体亲本之外,基因组的其余部分全部与受体亲本相同。这样,在
染色体片段代换系与受体亲本杂交的后代中,仅在代换片段上存在基因分离,因而QTL定位分析只局
限在很窄的染色体区域上,这就排除遗传背景的干扰,从遗传和统计两个方面保证了QTL定位的精确
性(方宣钧等,编著,2001,作物DNA分子辅助育种,科学出版社,中国,北京,pp.1-66).
1Hdl的克隆
水稻抽穗期性状的QTL精细定位和克隆研究进展较快。日本水稻基因组项目组已通过多次回交
及标记辅助选择成功地构建以粳稻“日本晴”为遗传背景,带有釉稻Kasalath”的目标染色体片段的近
等基因系(Yanoetal.,2001)。通过近等基因系与轮回亲本杂交,获得大规模的F2分离群体,用来克隆
QTL。水稻中第一个被克隆的QTL是控制抽穗期的主效基因— Hdl(Yanoetal.,2000)。之前日本科
学家Yamamoto等(1998)已经用上述群体对Hdl进行了精细定位。Yano等(2000)利用超过9
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