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rna合成和转录重点讲义
真核基因转录调控的DNA序列---顺式作用元件 顺式作用元件(cis acting elements) 概念:真核基因中与结构基因串联(较紧密的 或跳跃式的)并能调控转录水平的DNA 序列,包括启动子、增强子(沉默 子)、加尾及终止信号等。 与原核基因相比,在顺式作用元件中有较多、较复杂的共有序列,如TATA盒、CCAAT盒等。 但与原核基因不同是,顺式作用元件一般不含结构基因,也不一定与被调控基因串联,有时相距很远,甚至不一定处于上游。 增强子 概念:是一种可远距离对各种基因作用,能够促进基因转录,提高转录效率的顺式调控元件。 最早是在SV40病毒中发现的长约200bp的一段DNA,可使旁侧的基因转录提高100倍,其后在多种真核生物,甚至在原核生物中都发现了增强子。增强子通常占100-200bp长度,也和启动子一样由若干组件构成,基本核心组件常为8-12bp,可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。 沉默子 概念:与增强子的作用方式类似,也是一种可远距离对各种基因作用,但作用目相反,即抑制转录的顺式作用元件。 反式作用因子 概念:主要存在于真核生物的细胞核内的一类蛋白质,通过它们之间以及与顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用而调节转录活性。 反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的,则称为转录因子(transcriptional factors, TF)。 反式作用因子少数也是DNA结合蛋白。 有些基因可以合成调控自身的蛋白质分子 依赖ρ因子的转录终止 非依赖ρ因子的转录终止 帽子 0 结构 核酶的发现,对中心法则作了重要补充; 核酶的发现是对传统酶学的挑战; 利用核酶的结构设计合成人工核酶 。 图 6-7 原核生物转录过程中的羽毛状现象 5? 3? DNA 核糖体 RNA RNA聚合酶 (4)转录的终止和新生RNA链的释放 指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。 分类 依赖 ρ因子的转录终止(图6-8) 1969年,Roberts发现了能控制转录终止的蛋白质,即ρ因子。 它由相同的6个亚基组成六聚体,分子量200kD。 ρ因子具有NTP酶活性和解螺旋酶活性,是促使转录三元复合物解离的根本原因。ρ因子的NTP酶活性依赖于单链RNA的结构。 ρ因子依赖性终止子含有一个反向重复序列,使 RNA末端形成一个发夹结构,导致转录延宕,ρ因子得以发挥作用,终止转录。 图 6-8 非依赖 ρ因子的转录终止(图6-9) DNA模板接近转录终止的区域内,有较密集 的A-T配对区或G-C配对区,且G-C配对为回 文结构。 转录产物RNA的3′-末端有若干个连续的U。 连续U区的5′-端前方碱基形成茎环结构或发 夹结构。这种二级结构是阻止转录继续向下 游推进的关键。 转录方向 3′ 3′ 5′ TCGGGCG AGCCCGC CGCCCGA GCGGGCT AAAAAA TTT TTT 3′ 3′ 5′ 5′ DNA 模板链 编码链 AAAAAA UUUUUU 5′ CGCCCGA GCGGGCU 5′ TTTTTT DNA 模板链 编码链 转录产物 3′ 图6-9 不依赖 ρ因子的转录终止 茎环结构使转录终止的机理 使RNA聚合酶变构,转录停顿; 密集A-U 配对使转录复合物趋于解离,释放RNA。 5′pppG 5? 3? 3?5? RNA-pol 原核生物与真核生物转录的区别 原核生物 真核生物 RNA pol 一种 高度分工 起始转录因子 没有 需要(各不同) 延长核小体影响 没有 有 启动子以外序列 没有 有且复杂 转录产物 多顺反子 单顺反子 场 所 转录与翻译偶联 不偶联 转录终止 两种终止子 不明确 转录与复制的相似之处: ⑴ 都是酶促的核苷酸聚合过程; ⑵ 都以DNA为模板; ⑶ 都需依赖DNA的聚合酶; ⑷ 聚合过程都是核苷酸之间生成磷酸二酯键
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