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全基因组扩增策略在基因芯片分析SARS冠状病毒实验中的应用
24 3 CHINA BIOTECHNOLOGY 2004 3
SARS
1 1 1 1 1 1,2* 2
赵革新 任鲁风 刘凤杰 何新舟 董小岩 吴小兵 侯云德
( 1 100176)
( 2 100052)
针对SARS 冠状病毒的分子生物学检测是控制SARS 流行的关键环节为评价全基因组
扩 对SARS 微量样本检测的影响, 采用6mer 随机引物反转录, 用加接头的随机引物合成第二
链, 再以接头序列为引物扩 并掺入荧光标记, 最后与带有70mer 探针的基因芯片杂交此非特
异方法基本覆盖了样本中的全部DNA, 结果发现SARS 冠状病毒全基因组的扩 效果对基因芯
片杂交结果的均匀性有较大影响, PCR 循环次数 多会导致扩 均匀性的降低分析了不同的
引物对全基因组扩 均匀性的影响, 探讨了全基因组扩 策略的缺陷
SARS 冠状病毒 全基因组扩 基因芯片
( SARS), ( dege erate
, 2002 11 oligo ucleotide primed polymerase chai reactio , DOP
PCR)[ 3, 8] ( primer exte sio
, SARS preamplificatio , PEP) [4] ( multiple
, RNA displaceme t amplificatio ,MDA)[ 7] ,
30 , [3,4]
DNA
8000 , 900 ,
SARS , ,
SARS RTPCRELISA SARS
[ 1]
, ,
, SARS 1
SARS 11
SARS TOR2 , SARS RNA ( BJ01 ,
70 t, 25 t, 660 SARS ) ,TOR2
[ 2]
, SARS Ge ba k
SARS
12
(
) 3 SSC ,
, SARS
500 gl, ( CEL )
(wholege ome amplificatio ,WGA)
26 26 ,
DNA
0125l, 130m, 250m
,DNA
CEL
[3~ 7]
13
2l RNA ( Promega
: :
* , : wuxb0168@ si a. com ) ,
3 : SA
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