第九章 蛋白质组学数据分析.pdfVIP

北京伯奥克生物技术有限公司 Beijing Biock Bio-Technology Co.,Ltd 诚信务实，精诚合作！ 北京伯奥克生物技术有限公司创建于2003年，以“诚信务实，精诚合 作”为宗旨，致力于为高校、科研院 所、医疗系统的生物实验室提供用SELDI 蛋白质分离、检测以及生物信息学分析服务。公司由一批具有共同理想，充满 激情的创业者组成，拥有一支由教授、副教授、博士后和博士组成的强大研发 团队和具有丰富高新技术产业化经验的经营管理团队。公司与高等学校、医科 院相关研究机构建立了广泛的产学研合作关系，保证了公司持续的创新活力。 SELDI质谱分析平台 ◦ 公司拥有成熟的SELDI-TOF-MS技术，用于快速而有效地对蛋白样品进行分离、处理、数 据分析和鉴定；建立蛋 白质组数据库、发现疾病的相关蛋白和具有重要应用前景的生物标 记分子、建立疾病的早期诊断和治疗监测方法，我们愿为广大科研工作者提供先进的服 务——蛋白质样品SELDI-质谱-数据处理分析。公司拥有成熟的SELDI蛋白指纹图谱数据 库，用于肿瘤筛查及疗效判断等临床服务。 ▶ 蛋白质纯化鉴定服务 ▶ 质谱数据分析服务 ▶ 研究课题合作 生物信息学分析服务 ◦ 在组学时代，基因组、转录组和蛋白质组数据激增，使许多分子生物学家面对海量的数据 无法解读数据并锁定进一步研究的关键分子。生物信息学正是处理大规模组学数据，解决 难题的有力手段。公司具有优秀的生物信息学研究团队。为基因芯片数据分析及质谱数据 分析提供优质分析服务。 ◦ 基因组和转录组数据分析服务项目主要包括基因组和转录组的de novo组装，基因注释以及 功能分析，代谢途经分析等。 ◦ 蛋白质数据分析服务项 目包括质谱数据深度分析、蛋白质注释及功能分析、蛋白质相互作 用网络构建及分析、候选疾病标志物发现(蛋白质表达模式建模)、潜在药靶发现、蛋白质组 研究主题信息服务和专业数据库研发等。 基因组数据分析 转录组数据分析 蛋白质组数据分析 ◦ 基因组组装 ◦ 芯片数据标准化 ◦ 质谱鉴定、定量 ◦ 基因组注释 ◦ 差异表达分析 ◦ 蛋白质定位分析 ◦ 基因组功能分析 ◦ 聚类分析 ◦ 功能富集分析 ◦ 进化分析 ◦ 富集分析 ◦ PPI网络构建 ◦ 比较基因组分析 ◦ 调控网络构建 ◦ PPI网络分析 项目方案及分析服务咨询 ◦ 市场部：陈国良 经理 ◦ 手机 ◦ 邮箱：lmslmslms_1999@163.com 地址：北京市海淀区北三环西路48号科技会展中心3号楼20A 100086 电话：010 邮箱：glchen@ 主页： 北京伯奥克生物技术有限公司 Beijing Biock Bio-Technology Co.,Ltd 基因组数据分析案例 基因组数据分析案例 de novo基因组组装 • 对454，Illumina(Solexa)， SOLiD等第二代测序平台产生的 测序数据进行质量控制和组装， 主要指标包括基因组大小、 L50/N50、scaffold最大长度 等