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深海富钴结壳区宏基因组文库
深海富钴结壳区宏基因组文库 主要内容 宏基因组文库16S rDNA筛选及fosmid全长测定 宏基因组文库fosmid末端测序及初步分析 宏基因组文库16S rDNA筛选 筛选了218个96孔板,共20928个克隆 45个细菌克隆,主要分布于变形杆菌门和放线菌门,其中4个克隆与已知非培或可培种系亲缘关系较远(相似性95%) 42个古菌克隆,主要分布于泉古菌门 Fosmid全长测定 测定12个fosmid全长 现已得到两个fosmid全长结果 长度分别为38.5kb和34.2kb 宏基因组文库fosmid末端测序 得到2100个有效末端序列, 平均长度670bp 经比对,有金属离子耐受相关基因、压力耐受相关基因等环境适应相关基因,酯酶、脂肪酶、蛋白酶、几丁质酶、多种化合物加氧酶及水解酶等代谢相关基因。 微生物全基因组测序 全基因组测序 Pelagibacterium halotolerans B2 耐盐细菌 分离自东海海水 Halobiforma lacisalsi AJ5 嗜盐古菌 分离自新疆阿尔金山盐湖 Pelagibacterium halotolerans B2 已得到精细图 基因组大小:3.9 Mb 基因数:4,039 * *
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