番茄Mi-1基因的SNP分型.pdfVIP

第 41卷 第 1O期 东 北 农 业 大 学 学 报 41(1O)：36-42 2010年 lO月 JournalofNortheastAgiculturalUniversity Oct．201O 番茄Mi一1基因的SNP分型 李亚玲 ，李景富 ，康立功 ，张 贺 ，董晓慧z，许向阳 (1．东jE农业大学园艺学院，哈尔滨 150030；2．黑龙江省农业科学院绥化分院，黑龙江 绥化 152052) 摘 要：SNP分型是 SNP分子标记辅助育种，以及分子遗传作图等研究的重要基础技术。试验利用在番茄 一 l基因中开发出的一个AfF型SNP位点，应用等位基因聚合酶链式反应技术，成功的对438个F：群体进行了 SNP分型。结果表明，这一 F2群体中有72个纯合 r厂r基因型，175个杂合A／T基因型，70个纯合A，A基因型， 以及 121个不明原因缺失的F：单株，已得基因型经卡方测验符合 1：2：1分离比例；同时，试验通过在下游引物 3末端第二、三位点引入错配碱基，以及优化PCR反应体 系为Mg 1．875mmo]·L～，dNTP100txmol·L～，提高了 反应的准确性，为番茄抗根结线虫辅助育种打下了基础。 关键词：SNP；等位基因PCR(AS—PCR)；碱基错配；分型；番茄 中图分类号：$641．2；Q754 文献标志码：A 文章编号：1005—9369(2010)10—0036—07 SNP genotypingoftomatoMi-1gene／uYaling’，LIJingfu’，KANGLigong’，ZHANG He’，DONGXiaohui，XUXiangyang’(1．CollegeofHorticulture，NortheastAgriculturalUniversity， Harbin150030，China；2．SuihuaBranch，HeilongjiangAcademyofAgriculturalSciences，Suihua Heilongjiang152052，China) Abstract：SNP genotypingisanimportantresearchforSNPmolecularmarker-assistedbreeding andmoleculargeneticmappingtechniques，etc．Thestudysuccessfullycarriedout438 F2groupsSNP genotypeswithSNPsdetectedintomato Mi-1gene，andtheallele specificpolymerasechain reaction technology．Theresultsshowedthat72ofthem wereT／T homozygousgenotype．175ofthem wereA／1- heterozygousgenotype，70ofthem wereA／A homozygousgenotype，and 121oflhem unexplainedlost． Theseparationofgenotypesaccordedwiththeratioof1：2：1by test；Themethodofintroducingproper mismatched basedatthesecond orthethirdsitesofthe 3-end oftheanti—primerand optimizingthe reactionsystem tobeMg 1．875mmol·L。。，anddNTP 100 mO1．L。’bygradientPCRwhichhadimproved theaccuracyofthereaction．Itlaidthefoundationforassisted—breedingofthetomatoroot—knotnematode resistance． Key words：single nucleo