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纳米孔测序仪上市，测序竞争白热化 测序市场真是越来越红火，几乎每个月都有新品上市。去年底是 Life Tech的 Ion PGM，今年初则 是 Illumina的 MiSeq。这下，第三代测序公司 Oxford Nanopore Technologies也不甘落后，终于揭开 了其纳米孔测序平台的神秘面纱。 Oxford Nanopore Technologies （简称 了穿过孔中的电流。每个碱基ATGC 以及甲基胞 Oxford ）的测序平台名为GridION。之所以取这个 嘧啶都有自己特有的电流振幅，因此很容易转化成 看似有点奇怪的名字，据说是取单台仪器的联网和 DNA 序列。每个碱基也有特有的平均停留时间， 交叉通讯之意。GridION 不仅名字奇怪，样子也与 它的解离速率常数是电压依赖的，+180 mV 的电 别家的测序仪大相径庭，它看上去更像是一台 位能确保碱基从孔的另一侧离开。 DVD 或计算机的服务器（下图）。 该系统将使用带有多个蛋白纳米孔的阵列芯 片来分析DNA、RNA 和蛋白等。该阵列芯片放置 在一次性的cartridge 内，cartridge 随后上样到节 点内，就像放DVD 一样。Oxford 还计划开发一系 列cartridge，满足不同的分析物和应用。 GridION 系统能开展连续的系统监控，以便检 以上这台即是一部独立的仪器，Oxford 称之 查实验参数、试剂体积等等。它还能实时分析序列 为“节点（node ）” 。它高约为 8.9 cm ，深约为 数据和数据质量。该系统还给予操作员设计实验的 50.8cm，重仅为10 kg。也许你不禁怀疑，与其他 灵活性，让他们运行实验，直到达到预先确定的序 的测序仪相比，它为何如此迷你？哦，这虽是一部 列覆盖度或蛋白浓度。 独立仪器，但也可以作为一个单元，组装成一个更 Oxford 尚未公布任何初步的序列数据，这不 大的系统。用户能够连接若干个这样的节点，平行 免让人有些失望，但似乎并不奇怪，因为 Oxford 工作，节约处理时间。 的两大高层 Clive Brown 和 John Milton 曾是 据Oxford 的首席技术官Clive Brown 介绍， Solexa 的关键人物。当时，他们也未曾公布Solexa 用户可同时运行3000 个。这样就组成了一个可扩 技术平台的任何细节，直至2008 年，突然宣布已 展的测序平台。Brown 认为，GridION 系统的可扩 经完成了个人基因组的测序。 展性将让它既适合大型测序中心，又可满足小型实 如果你对 GridION 系统有点兴趣，那可要有 验室的需求。 点耐心了，因为Oxford 还没有宣布正式推出的日 至于 GridION 的测序原理，生物通之前曾有 期。该系统正处于最后阶段的开发，并通过内部应 介绍，详见《廉价的第三代纳米孔测序》。基本原 用进一步完善。请关注生物通的后续报道。 理为：当核酸外切酶消化单链DNA 后，单个碱基 （生物通余亮） 落入孔中，它们瞬间与环式糊精相互作