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大豆高密度SNP标记遗传图谱构建
47 6 Vol. 47 No. 6
第 卷 第 期 河 南 农 业 大 学 学 报
2013 年 12 月 Journal of Henan Agricultural University Dec. 2013
文章编号:1000 - 2340 (2013)06 - 0671 - 06
大豆高密度SNP 标记遗传图谱构建方法的比较
1,2 , 2 , 2 , 2 , 3 ,PERRY Cregan3 , 1 , 1
谭 文 顾 王 宋 邢 李
瑞娟 自翔 翠华 德春 启建 小萍 洪连
( 1. , 南 郑州 450002 ; 2. 密歇根 州立大学植物土壤微生物 系,
河南农业大学植物保护学院 河
48824 ; 3. , 20705)
密歇根 东兰辛 美国农业部农业研究服务 中心 马里兰 贝尔茨维 尔
: U01 - 390489 × E07080 F 96 C2 50
摘要 以对大豆猝死病抗性不同的大豆品 系 所衍 生的 4 : 5 代 个 家系的 连锁群上
SNP , Joinmap4. 0 Icimapping 2
个 多态性 标记位点为基础数据 对 比分析 了利用 及 个软件不同计 算方法所构建 的
遗传 图谱的异 同及优劣. 结果表 明,Icimapping 构建 的 图谱长度较 Joinmap4. 0 所建图谱短 ,Icimapping 包含 的几
种算法构建的 图谱长度相近 ,Joinmap 中 Regression 的计算方法所构建 的遗传 图谱与 soybase 上的一致 图谱长度
最为接近 ,Maximum Likelihood 算法得出 的 图谱长度与 Fixed Order 算法 图谱长度相近. Icimapping 的构建的 图谱
, , . Joinmap regression ,
中 较 多的标记聚集于 同一位点 其 中的几种 算 法相 近 中 算 法 的 图谱结果乱序标记 较 多
Maximum Likelihood , Fixed Order . ,Joinmap Maxi-
构建的 图谱乱序标记较 少 与 的结果更为接近 研究 结果表 明 的
mum Likelihood 算法更适合 于高密度 的 SNP 标记的 图谱构建.
: ;
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