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第 卷第 期 数 据 采 集 与 处 理
年 月
文章编号
基于聚类和微粒群优化的基因选择方法
刘金勇 郑恩辉 陆慧娟
中国计量学院机电工程学院杭州 中国计量学院信息科学学院杭州
摘要在高维的基因表达谱数据中只有少量基因对分类诊断其作用而且还存在大量冗余的与癌症分类诊断无
关的噪声基因这些都会导致分类性能的下降通过基因选择选取与分类紧密关联的基因不仅能够剔除与疾
病无关的基因减少机器学习算法的时间复杂度和空间复杂度提高分类的正确率而且选出的特征基因可以作
为肿瘤基因诊断和肿瘤药物治疗靶标确定的依据降低后期生物学分析成本本文提出一种基于聚类和粒子群
算法 的基因选择方法在 算法进行搜索之前先对基因进行聚类并对
聚类结果进行选择将被选中的簇的中心作为 的初始值每个被选中的簇作为一个搜索空间并利用极限
学习机 的分类精度作为特征选择的适应评价标准该算法不仅有效地利用了
聚类算法对基因进行初步归并的能力也利用了 算法的全局优化能力克服了传统 算法早熟局部收
敛速度慢的缺点因此它能够高效地完成最优基因子集的确定同时提高癌症分类正确率
关键词基因表达谱数据基因选择微粒群优化极限学习机
中图分类号 文献标识码
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