第三章生物信息传递上从dna到rna.ppt

TFs 帮助RNA聚合酶识别启动子。TFs ( 转录因子）必须先与DNA形成复合物，帮助RNA聚合酶定位到转录起始的位点。 RNA聚合酶和转录因子在DNA上的定位形成前起始复合物，由于转录因子的作用复合物由封闭型转换成开放型。 出现故障时，RNA聚合酶停止前进并回撤； 在RNA的3端切割，形成新的3-OH末端； 重新开始延伸RNA链。 第二节 转录机器的主要成分 在某些细菌细胞内含有能识别不同启动子的σ 因子，以适应不同生长发育阶段的要求，调控不同基因转录的起始。 真核生物RNA聚合酶一般由8~16个亚基所组成。其中RNA 聚合酶II的两个大亚基（RPB1和RPB2）与细菌核心酶的两个大（β和β）；（RPB3和RPB11）与α亚基同源；RPB6与ω亚基同源。 真核生物RNA聚合酶共性：聚合酶中有两个相对分子质量超过 1 x 105 的大亚基；三类聚合酶有“共享”小亚基的倾向。 RNA聚合酶I的转录产物是45S rRNA，经剪接修饰后生成除5S rRNA外的各种rRNA。 RNA聚合酶II在核内转录生成hnRNA，经剪接加工后生成成熟mRNA被运送到细胞质中作为蛋白质合成的模板。 核不均一RNA（heterogeneous nuclear RNA，hnRNA）：核内未被剪接的有内含子的mRNA前体，或是核内mRNA的初级转录产物。 RNA聚合酶III的转录产物是tRNA，5S rRNA，snRNA。 SnRNA（small nuclear RNA），即核内小RNA，主要存在于核内，是核内100~300个核苷酸序列的小型RNA，参与RNA的剪接。 蟹爪 DNA转录循环理论 1、NTP填补了开放的底物位点，并在活性位点形成磷脂键； 2、处于聚合酶中心的核酸发生位移，其是连接区α螺旋结构由笔直变为弯曲再恢复成为笔直状态，为下一轮RNA的合成留出了空的底物位点。 转录因子（transcription factor, TF）：真核生物转录起始过程中，除RNA聚合酶之外的其它辅助因子统称为转录因子。 小 结 第三节 启动子与转录的起始 一、启动子区的基本结构 启动子（promoter）：是一段位于结构基因5’端上游区的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确地结合并具有转录起始的特异性。 三、RNA聚合酶与启动子区的结合 四、-10区和-35区的最佳距离 -10与-35区的距离在16-19 bp之间，否则会降低启动子的活性。即一旦-10与-35区间的超螺旋结构发生改变，RNA聚合酶就难以保持正确的取向。 五、增强子及其功能 增强子或强化子(enhancer)：指能强化转录起始频率的DNA序列。 六、真核生物启动子对转录的影响 真核生物启动子 七、转录的抑制 小 结 3、原核生物mRNA 5′端无帽子结构，3 ′ 端没有或只有较短的poly(A) 结构，在起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处有6个核苷酸的保守序列，被称为SD序列。 SD序列在与核糖体的结合过程中起作用。 帽子结构的作用: 1、提高mRNA的活性及稳定性； 2、作为蛋白质合成起始信号的一部分。 小 结 第五节 终止和抗终止 问 题 转录的基本过程？ 终止子的类型，它们各自的作用机理？ 细菌及真核生物启动子的特征？ 原核生物及真核生物 mRNA 特征? 什么是多顺反子？什么是单顺反子？ 第六节 内含子的剪接、编辑、再编辑及化学修释 一、RNA中的内含子 外显子（exon）：基因中与mRNA一致的序列。一个基因总是以外显子为起点和终点。 内含子（intron）：基因中编码序列之间的介入序列，在原初转录物加工为mRNA时被去除。 内含子的剪接方式有： 组成性剪接：在高等真核生物中，内含子通常是有序或组成性地从mRNA前体中被剪接，这种剪接方式称为组成性剪接。 变位剪接：又叫选择性剪接，指在剪接过程中可以有选择性地越过某些外显子或某个剪接位点进行变位剪接，产生出不同mRNA，这种剪接方式称为变位剪接。 Ⅱ类内含子主要存在于真核生物的线粒体和叶绿体rRNA基因中。 三、RNA的编辑、再编码及化学修饰 1、RNA的编辑 指某些RNA，特别是在mRNA中插入、删除或取代一些核苷酸残基，导致DNA所编码遗传信息的改变，从而翻译出多种氨基酸序列不同的蛋白质。结果使成熟mRNA的核苷酸序列不同于前体，也不同于DNA模板，使遗传信息在mRNA水平上发生改变。 介导RNA编辑的机制有两种： a、脱氨基作用 b、引导RNA指导的尿嘧啶插入或删除 (1)、单碱基突变(脱氨基作用） (2)、尿苷酸的缺失