动物遗传学第九章动物基因组学.pptVIP

一、什么是人类基因组计划？ 人类基因组计划（Human Genome Project , HGP)是指通过测定人类基因组DNA的3×109对核苷酸的序列，探寻所有人类基因并确定他们在染色体上的位置，明确所在基因的结构及功能，解读人类的全部遗传信息，使得人类第一次在分子水平上全面认识自我。 二、为什么启动人类基因组计划？ 随着研究的不断深入，人们对DNA的认识越来越深，我们有必要对人类所有遗传信息进行测序，同时由于测定方法的完善，使得进行人类基因组测序成为可能。 四、人类基因组计划结果公布 多国合作小组2001年在Nature上公布结果 Craig Venter博士采用鸟枪法于Science上发表结果。 人基因组测序的完成可与人类登月媲美。 序列测定方法 1 全基因组鸟枪法： 在一定作图信息基础上，绕过大片段连续克隆系的构建而直接将基因组分解成小片段随机测序，利用超级计算机进行组装（美国Celera公司）。 五、人类基因组计划的意义 第一：获得人类全部基因序列将有助于人类认识许多遗传疾病以及癌症等疾病的治病机理，为分子诊断、基因治疗等新方法提供理论依据。 第二：破译生命密码的人类基因组计划有助于人们对基因的表达调控有更深入的了解。 第三：人类基因图谱对揭示人类发展，进化的历史具有重要意义。 六、其它物种基因组 2000年3月，“全基因组鸟枪法”获得果蝇全基因组序列，发表在Science上。 2000年10月，美英等科学家宣布绘出拟南芥基因组的完全图谱，这是人类首次破译出一种基因的序列。 水稻基因组—我国二十世纪的大事 第二节 基因组学及蛋白质组学 一、基因组与基因组学 基因组（Genome）就是指生物体染色体、细胞器中所含的全套遗传物质；一种生物全部基因的集合称为“基因组”。 基因组学（Genomics）就是研究基因组结构和功能的科学。 结构基因组学 1、概念和目的 以全部基因组测序为目标的基因结构研究，弄清基因组中全部基因的位置和结构，为基因功能的研究奠定基础。其目的是建立高分辩的遗传图谱、物理图谱、转录图谱和序列图谱。 2、结构基因组研究常用方法 1 脉冲场凝胶电泳：改变电场方向和调整脉冲时间，将长度不同的DNA分开。 2 毛细管电泳：可用于单核苷酸改变的寻找，短串联重复序列的检查，DNA测序，基因及其表达产物的分析。 3 基因芯片技术：可用于表达谱测定、突变检测、多态性分析、基因组文库作图和杂交测序等。 4 全基因组随机测序（全基因组鸟枪战略）：先打断DNA测序，然后作图。 功能基因组学 1、概念： 利用结构基因组学提供的信息，以高通量，大规模试验方法及统计与计算机分析为特征，全面系统的分析全部基因的功能。 2、基因功能从研究角度包括：生物学功能、细胞学功能、发育学功能等。 3、功能基因组学研究的方法 差异显示反转录PCR 基因表达序列分析（SAGE） 基因芯片或微点矩阵 RNA干涉技术 遗传足迹法 发求遗传学 蛋白质组学和生物信息学方法 （二）比较基因组学 利用生物在进化上的亲缘关系,来比较它们与人类之间的相似与相异,即比较基因组学。 蛋白质组学研究方法 1 用于蛋白质分离技术方面的如双向凝胶电泳，双向“高效”柱层析等 2 用于蛋白质鉴定技术如质谱技术，凝胶图像分析，蛋白质和多肽的N端，C端测序及氨基酸组成分析 3 用于蛋白质相互作用及作用方式研究的双杂交系统 4 用于分析大量数据的生物工程信息学等 一、遗传图谱：又称连锁图谱(linkage map)， 应用遗传学技术构建能显示基因以及其它序列特征在基因组上位置的图。 方法是以多态的遗传标记作为界标，计算细胞减数分裂过程中遗传标记之间发生重组的频率，来确定两个遗传标记在染色体上的相对位置。 遗传标记之间的相对距离即图距以厘摩（cM，厘摩尔根，centi-Morgan）为单位。当两个遗传标记之间的重组值为1%时，图距即为1cM。 现代遗传图的概念是于1980年提出的，就是将单纯的表型多态性界标改变为以DNA序列的多态作为作图界标。 各种遗传界标可在国际互联网上可以查阅（）。 当用DNA序列多态作为界标的遗传图时，一但确定该DNA界标与某一基因的具体位置，便可分离克隆这个基因。 人类第一张以RFLP为界标的遗传图发表于1987年。 遗传图的局限性 1.分辨率有限 高等真核生物子代数量有限，只有少数的减数分裂事件可供研究，连锁分析的分辨率受很大限制 2.精确度较低 假设交换是随机发生的，但由于交换热点的存在使某一区段的交换频率远高于其它区段，无法绘制精确的遗传图。