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哺乳动物组织基因组DNA提取(综合性实验)
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本科学生综合性实验报告
学号: %%%%%% 姓名: @@@@
学院: 生命科学学院 专业、班级: 11应用生物教育A班
实验课程名称: 哺乳动物组织基因组DNA提取
教 师: 张 玲
开 课 学 期: 2013 至 2014 学年 上 学期
填 报 时 间: 2013 年 10 月 19 日
云南师范大学教务处编印
一.实验设计方案
实验序号及名称:综合性实验: 哺乳动物组织基因组DNA提取(Genomic DNA Extraction from Mammal Tissue) 实验时间 第5、7、8周 实验室 睿智楼3幢422(生物综合实验室1) (一)实验目的(Experimental Purpose):
1.掌握动物基因组DNA提取的操作方法;
2.掌握琼脂糖凝胶电泳的操作的方法。
After the experiment is finished, students should be able to extract genomic DNA from mammal tissue, and to run an agarose gel. (二)实验原理(Experimental Principle):
本实验利用去垢剂SDS(十二烷基磺酸钠)是为了使蛋白变性并溶解细胞膜中的脂质从而导致细胞裂解,而细胞裂解物又常用蛋白酶K进行水解处理。
随后用酚:氯仿进行抽提,以去除残留的蛋白质,这时蛋白质将进入有机相,或者假如己变性的话将呈现在有机相与水相之间。乙醇沉淀处理则可以浓缩DNA,同时去除核苷酸、氨基酸以及低分子量的寡核苷酸和肽。
为了进一步保护DNA样品的完整性,通常需要在缓冲液中添加乙二胺四乙酸(EDTA)以整合Mg2+,这样将会减少脱氧核糖核酸酶(DNase)的活性,因为该酶必须在有Mg2+存在时才会起作用。
本实验方法分离得到的染色体DNA长度为100-150kb,适用于构建基因组文库和Southern杂交分析。如果要求得到较大分子量的DNA,则必须省略其中的振荡步骤。
In the procedure described here, the detergents SDS ( sodium dodecyl sulfate) are added to denature proteins and solubilize lipids in membranes leading to cell lysis . The cell lysate is often treated with enzymes that hydrolyze RNA and proteins.
This is generally followed by phenol of phenol: chloroform extraction to remove the remaining proteins, which will either enter the organic phase or, if denatured, appear at the interphase . Chloroform treatment is used to remove the phenol, and alcohol precipitation concentrates the DNA while removing nucleotides, amino acids, and low - molecular- weight oligonucleotides and peptides.
As a further precaution, ethylene diamine tetraace-tic acid (EDTA) is include-ed in the buffers to chelate Mg2+. This will reduce deoxyribonuclease (DNase) activity because of the Mg2+ requirement of these enzymes.
The protocol described here result in DNA that is easily cut with restriction en
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