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植物关联分析中遗传关系的一般分析方法
杨小红
中国农业大学国家玉米改良中心
55.2323
1
遗传关系是影响关联分析的重要因素遗传关系是影响关联分析的重要因素
yy == XXββ ++ SSαα ++ QQvv ++ ZZuu ++ ee
Environments,
etc.
BackgroundBackground
Candidate
Genetic effects,
Trait SNP effects
Var(u) = 2KV
A
valuesvalues
Subpopulation
effects
Yu et al., Nat Genet 38: 203‐208 (2006)
2
群体结构群体结构————QQ矩阵矩阵
STRUCTURESTRUCTURE (P(Priitchhardd et all, GGenetiics, 155155: 945945–959)959)
/software.html
InStrucInStruc ((GaoGao etet alal, GeneticsGenetics, 176:176: 1651)1651)
/InStruct.aspx
frappefrappe (Tang(Tang etet alal, GeneticGenetic EpidemiologyEpidemiology 28:28: 289289–301)301)
/tanglab/software/frappe.html
3
如何判断群体的亚群数如何判断群体的亚群数？？
Vigouroux et al., American Journal of Botany 95(10): 1240–1253 (2008)
4
0
1
？？ 9
数数 8
群群
亚亚
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