精细定位与候选基因预测.pdf

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中国科技论文在线 水稻抽穗期 QTL DTH2 的精细定位和候选 基因预测# 1 1 1 2 1** 吴玮勋 ,江玲 ,陆广文 ,钟铮铮 ,万建民 5 (1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京 210095; 2. 中国农业科学院作物科学研究所,北京 100081) 摘要:抽穗期是水稻中的一个重要性状,决定水稻适应不同的栽培地区和播种季节。本文中, 我们发现了一个新的微效QTL DTH2 ,仅在长日照条件下促进开花。DTH2 的遗传效应最初 在染色体片段置换系23 (CSSL23 )中确定,然后用CSSL23/Asominori BC F 群体对该QTL 4 2 10 进行定位。用标记辅助选择的方法从BC F 群体中开发了一个近等基因系(NIL )。通过图 4 2 位克隆的方法我们把DTH2 定位在37.6-Kb 的基因组范围内,其间有9 个预测的开放阅读框 (ORFs ),其中ORF5 和拟南芥COL9 有51%氨基酸序列的同源性,后者通过降低CO 和 FT 的表达从而在拟南芥中长日照条件下延迟开花。我们于是推测ORF5 是候选基因。该研 究为图位克隆DTH2 基因提供了基础。 15 关键词:水稻;DTH2;抽穗期;微效QTL 中图分类号:S511.S330.2+5 Fine mapping of the heading date QTL DTH2 and prediction of candidate gene in rice (Oryza sativa L.) 1 1 1 2 1 20 WU Weixun , JIANG ling , LU Guangwen , ZHONG Zhengzheng , WAN Jianmin (1. State Lab of Crop Genetics and Germplasm Ehancement, Nanjing Agricultural University, NanJing 210095; 2. Cro Science Institute, CAAS, Beijing 100081) Abstract: Heading date (HD) in rice is a key determinant for its adaptation to different cultivation 25 zones and cropping seasons. Here, we discover a newly identified minor-effect QTL DTH2, which promotes flowering only under long-day conditions

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