基于ITS序列分析钩苞大丁草九个居群的亲缘关系.PDF

ｈｔｔｐ：／ ／ ｊｏｕｒｎａｌ．ｇｘｚｗ．ｇｘｉｂ．ｃｎ － 　 Ｇｕｉｈａｉａ　 Ｍａｒ． ２０１７，３７（３）：３２９ ３３４ － ｈｔｔｐ：／ ／ ｗｗｗ．ｇｕｉｈａｉａ ｊｏｕｒｎａｌ．ｃｏｍ ＤＯＩ：１０．１１９３１／ ｇｕｉｈａｉａ．ｇｘｚｗ２０１６０９０２０ － 引文格式：王谈笑，郑伟，陈菁，等．基于ＩＴＳ序列分析钩苞大丁草九个居群的亲缘关系 ［Ｊ］． 广西植物，２０１７，３７（３）：３２９ ３３４ ＷＡＮＧＴＸ，ＺＨＥＮＧＷ，ＣＨＥＮＪ，ｅｔａｌ．Ｇｅｎｅｔｉｃｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐａｎａｌｙｓｉｓｏｆ ＧｅｒｂｅｒａｄｅｌａｖａｙｉｆｒｏｍｎｉｎｅｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｂａｓｅｄｏｎＩＴＳｓｅｑｕｅｎｃｅｓ［Ｊ］．Ｇｕｉｈａｉａ，２０１７， － ３７（３）：３２９ ３３４ 基于ＩＴＳ序列分析钩苞大丁草九个居群的亲缘关系 １ ２ １ ２ ３∗ 王谈笑 ，郑　 伟 ， 陈　 菁 ，王　 炜 ，徐晓丹 （ １． 昆明理工大学 现代农业工程学院，昆明６５０５００；２． 昆明理工大学 建筑与城市规划学院， 昆明６５０５００；３． 昆明理工大学 艺术与传媒学院，昆明６５０５００ ） 摘　 要：该研究对我国西南地区钩苞大丁草（Ｇｅｒｂｅｒａ ｄｅｌａｖａｙｉ）９个居群ｒＤＮＡ ＩＴＳ序列进行ＰＣＲ 的扩增和检 测序列，并以非洲菊（Ｇ．ｊａｍｅｓｏｎｉｉ）的ＩＴＳ序列作为外类群，比较了序列之间的差异，同时分析了钩苞大丁草不 同居群在地理距离与遗传距离之间的关系，构建了ＮＪ系统发育树。 结果表明：（１）钩苞大丁草９个居群的ＩＴＳ ＋ 序列全长介于６００～７００ｂｐ之间，平均长度约为６５７ｂｐ，其中，ＩＴＳ１长度为２４３～２４６ｂｐ，（Ｇ Ｃ）含量为４５．６７％～ ＋ ＋ ４６．８０％之间，５．８Ｓ长度 １９１～１９３ ｂｐ，（Ｇ Ｃ）含量为５８．６０％～５８．６１％之间，ＩＴＳ２长度为２２０～２２１ｂｐ，（Ｇ Ｃ）含 量为５７．００％～５７．４５％之间；ＩＴＳ序列共有２２个变异位点，ＩＴＳ１序列（１７个）、５．８Ｓ序列（２个）以及ＩＴＳ２序列（３ ２ ＝ 个）上均有变异。 （２）地理距离与遗传距离有正相关（ｒ ０．６５２），序列间遗传分化距离为０．００１１～０．０２４ ３，其 中普洱居群与其他居群间遗传距离最大。 （３）钩苞大丁草９个居群分成三个分支，普洱居群单独成支，丽江和 洱源居群聚为一支，富源、武定、德昌、石林、新平和开远６个居群聚为一支。 ｒＤＮＡ ＩＴＳ序列可以用于钩苞大丁 草群体遗传研究的分析，该研究结果