基于遗传算法的猕猴桃的培苗变异的仿真.docx

程序设计报告（利用遗传算法仿真猕猴桃组培苗变异）学院：专业：姓名：学号：指导老师：昆明理工大学目录一、绪论任务 -------------------------------------- 3对象 -------------------------------------- 3意义 -------------------------------------- 3技术路线 -------------------------------- 3遗传算法 -----------------------------------5二、设计框架 --------------------------------------- 7程序流程图 ------------------------------- 7运行结果 ----------------------------------- 9分析总结 ----------------------------------- 11三、软件著作权软件结构与开发环境----------------------11设计说明---------------------------------------12附录----------------------------------------------12四、心得体会-----------------------------------------13一、绪论31、任务32、对象33、意义44、技术路线41、JDK的获取42、JDK的安装及环境变量的配置43、Eclipse的获取与安装65、遗传算法61、选择：62、交叉73、变异74、终止条件8二、设计91、框架92、程序流程图93、运行结果104、分析总结12三、软件著作权131、软件结构与开发环境132、设计说明133.附录13四、心得体会15一、绪论1、任务掌握JAVA语言环境的搭建，利用生物分子学内容，通过适应性函数等相关遗传算法对贝酵母SSUI基因的部分基因序列进行识别，筛选。最终观察分析结果，从适应度等角度得到变异前后的差别联系，得到最优基因。2、对象贝酵母SSUI基因的部分基因序列。3、意义基因识别是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。基因识别是基因组研究的基础。利用JAVA程序的搭建，运用遗传算法对基因序列进行一代一代的变异遗传，然后对结果进行分析对比，得到最优基因。最优基因的个体具有较强的适应性，是最适合环境的生物个体。据此可以对遗传规律进行总结，对生物进行筛选。4、技术路线1、JDK的获取从Oracle公司的网站上可以免费获取各种版本的JDK，Oracle公司的网址。注意这次设计实用的是JDK 1.72、JDK的安装及环境变量的配置JDK有安装版和直接解压版。安装版安装方法如下：（1）找到下载的安装包，双击运行。注意：如果是32位系统运行jdk-7u60-windows-i586.exe，64位操作系统运行jdk-7u60-windows-x64.exe。（2）按照系统提示安装JDK，需注意的是再安装时安装路径尽量不要再C盘，并且安装路径不要包含空格和中文。（3）环境变量配置Windows XP：在桌面右击“我的电脑”，然后单击“属性”，在“系统属性”对话框中选择“高级”选项卡，然后单击“环境变量”按钮，打开“环境变量”对话框，找到“系统变量”中名为Path的行，单击编辑，将JDK中bin目录的安装路径加入到环境变量中。为了编程方便可以新建一个classpath的环境变量，并将JDK中lib目录的安装路径加入到该环境变量中。Windows 7，windows 8，windows 8.1：在桌面右击“我的电脑”，然后单击“属性”，在“系统”对话框中选择“高级系统配置”，在打开的“系统属性”对话框中选择“高级”选项卡，然后单击“环境变量”按钮，打开“环境变量”对话框，找到“系统变量”中名为Path的行，单击编辑，将JDK中bin目录的安装路径加入到环境变量中。为了编程方便可以新建一个classpath的环境变量，并将JDK中lib目录的安装路径加入到该环境变量中。3、Eclipse的获取与安装Eclipse是IBM的开源项目，可以从Eclipse官方网站（ ）免费获取。将下载的压缩包解压至一个不包含中文字符的目录下，即完成安装。双击eclipse.exe打开eclipse。5、遗传算法遗传算法（Genetic Algorithm）是模拟达尔文生物进化论的自然选择和遗传学机理的生物进化过程的计算模型，是一种通过模拟自然