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三、光合作用 1.藻类的光合作用(同绿色植物) 白天,在有光的条件下,利用体内的色素(叶绿素、类胡萝卜素、藻蓝素、藻红素等),从H2O的光解中获得H2,还原CO2成[CH2O]。 总反应式为:CO2+H2O →[CH2O]+ O2 2.细菌的光合作用 细菌光合作用的供氢体为H2S和H2。因光合细菌种类不同,其光合反应也有所不同。有三种生化反应: (1)绿硫细菌属 CO2+2H2S →[CH2O]+ 2S+ H2O (2)红硫细菌科 2CO2+H2S+2 H2O→2[CH2O]+ H2SO4 (3)氢单胞菌属 CO2+2H2 →[CH2O]+H2O 光合细菌通过光周期把CO2固定,并转变为高能贮存物——聚β羟基丁酸(PHB)。 CO2固定的途径为卡尔文循环,详见图。 3.有机光合细菌的光合作用 以光为能源,以有机物为供氢体还原CO2,合成有机物。有机酸和醇是它们的供氢体和碳源。 例如,红螺菌科的细菌能利用异丙醇作供氢体进行光合作用,并积累丙酮。 (CH3)2CHOH+ CO2 → 2CH3COCH3+[CH2O]+H2O 4.藻类光合作用与细菌光合作用的比较 详见下表 藻类光合作用与细菌光合作用的比较 四、异养微生物的合成代谢 异养微生物利用现成的有机物作碳源和能源,用分解过程中的中间代谢产物和分解代谢中得到的ATP合成自身细胞的组成成分。 * 丙酮酸脱氢酶由三种酶蛋白及硫辛酸、焦磷酸硫胺素、FAD、NAD、CoA5种辅酶 酶蛋白:起加速生物化学反应的作用 辅助因子:包括辅基和辅酶,起传递电子、原子和化学集团的作用,有机物可作为辅基和辅酶,金属离子一般作为辅基。二者的差别在于辅酶和酶蛋白结合较为疏松,而辅基牢固。金属离子除了传递电子,还起到激活剂的作用。 许多酶在有适当激活剂的存在下才表现出催化活性或者强化催化活性,这类酶在不解和金属离子的状态下称为酶原。 重要的辅基: 铁卟啉:过氧化氢酶、细胞色素酶、过氧化物酶的辅基,依靠Fe变价传递电子。 辅酶A:通过-SH的受酰和脱酰参与转酰基反应。 NAD、NADP:烟酰腺嘌呤二核苷酸(磷酸):是多种脱氢酶的辅基,其传递氢的作用。 FMN(黄素单核苷酸)和FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸):黄素酶类,是氨基酸氧化酶和琥珀酸脱氢酶的辅基,电子传递体系的组成部分。 专性厌氧菌特有辅酶:多为甲基载体,和产甲烷代谢活动相关。 从广义上说,凡能促进酶及反应物进入活化状态从而加速酶催化反应的物质都能称为辅因子,它包括种类很广的物质。英汉生化词典将辅因子(cofactors)定义为“一种酶的活性所需要的一种非蛋白质成分”。这种辅因子可能是一种金属离子激活剂或一种有机分子(辅酶)。它们或松或紧地与酶相结合;紧密接合的辅因子称为“辅基”。将激活剂(activator)定义为“一种金属离子,作为一种酶的辅助因子。” 在前面已谈到,测酶活性浓度时应该在最适条件下测酶反应的最大速度。如测定酶需要辅因子,活化剂时,应选择合适的种类和浓度加入到测定酶的体系中,在些过程中可能会涉及到下列四类物质。 首先是辅酶(Coenzyme)。很多酶反应都必须有辅酶参加。如相当部分的还原酶需要辅酶Ⅰ(NAD+)和辅酶Ⅱ(NADD+)参加。ATP是激酶(Kinase)反应中不可少的辅酶,这类物质一般是小的有机化合物,和辅基不同点是与酶蛋白结合很松弛,用透析和其它方法很易将它们与酶分开,尽管它们不用于酶的底物,特异性不强,往往参加一系列酶反应和代谢过程。但在作用方式上和底物类似,在酶反应过程中与酶结合、分离及反复循环。在方法学上,可将它们按底物处理,即可按米-门方程式求出其Km,按底物规律选择其浓度。 第二是辅基,辅基虽也是小的有机化合物,但却是酶蛋白不可分割部分,不含辅基的酶蛋白称为脱辅基酶蛋白(apoenzyme),没有催化活性,必须加入足量辅基,和它结合成为全酶(holoenzyme),才可能有催化活性。最典型的例子是各种转氨酶需要磷酸吡哆醛为其辅基,在反应过程中。氨基酸将其氨基交给吡哆醛变为吡哆胺,本身接受醛基成为酮酸,然后吡哆胺将氨基转交给酮酸生成氨基酸,本身又变回吡哆醛。从此机制不难理解为何脱辅基酶蛋白无催化活性。 辅基和辅酶不同点不仅表现在和酶蛋白结合紧密,不易为透析所除去,和酶作用方式也不同,不似辅酶迅速与酶结合,又迅速分解为酶和产物,辅基显著特点之一是与酶结合需要一定时间,因此在酶测定时,如按底物一样来处理辅基,在酶反应开始时才加入辅基,则开始阶段反应较慢,经过一段延滞期后,反应才达到应有速度。因此在酶测定时,往往是先加入足量辅基,作用一定时间如10分钟后,再加入底
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