AME肝癌时间多组学深度测序技术完美鉴别肝癌发生模型.PDF

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AME肝癌时间多组学深度测序技术完美鉴别肝癌发生模型

临床与病理杂志 2015, 35(5) 716 J Clin Path ol R e s doi: 10.3978/j.issn.2095-6959.2015.05.005 View this article at: /10.3978/j.issn.2095-6959.2015.05.005 ·AME 科研时间专栏 · 专栏导读 :AME Groups 旗下出版了Journal of Thoracic Disease ( 《胸部疾病杂志》) 、Annals of Cardiothoracic Surgery ( 《心胸外科年鉴》) 、Chinese Journal of Cancer Research ( 《中国癌症研究》) 和Annals of Translational Medicine ( 《转化医学年鉴》) 等近20 本英文医学学术期刊。2014 年,AME Groups 中文平台——“科研时间”的诞生,为广大从事临床和基础研究 的科研工作者带来了福音,提供了更多科研交流和学习分享的机会。欢迎广大读者关注我们“AME 科研时间专栏”, 订阅我们的公众微信号 ( 科研时间:amegroups) ,给我们提出宝贵的建议和意见,以便于将这个专栏建设得更好,成 为读者喜闻乐见的一个栏目。 AME肝癌时间 | 多组学深度测序技术完美鉴别肝癌发生模型 Haruhiko Takeda (Department of Gastroenterology and Hepatology, Graduate School of Medicine, Kyoto University, Japan) 肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma ,HCC ,下 变异构建的系统进化树中,P1 的原发肿瘤、门静 [1] 称肝癌)是全世界第三大致死性肿瘤 。虽然已经 脉癌栓和肝内转移灶均远离种系基因组,而肝内 有大量研究对肝癌发生的分子机制进行了探索, 转移病灶与种系之间的距离最远;但P2 的多发肿 但目前仍未发现十分有效的诊断或预后因素及治 瘤与种系的距离及肿瘤之间的距离是相同的。这 疗靶点。 个发现提示P1 所有的肝内病灶均由原发肿瘤转移 在近期的调查性研究《多组学分层分析乙肝 而来,而P2 的肝内结节则来自独立的分子过程。 病毒相关肝细胞肝癌并发现预后标记物》中,缪 然后,作者分析了P 1 和P 2 的肿瘤基因表达 等使用全面的基因组和转录组分析的方法描述了 谱,发现P1 各个病灶基因表达谱相同。信号通路 多灶性肝癌的特征,发现了新的能够预测患者生 分析发现,P1 所有病灶中存在相同的基因下调, [2] 存时间的生物标记物 。在研究中,作者对比分析 而P2 各个病灶具有不同的转录组改变。另外,与 了两个接受手术切除而预后截然不同的多灶性肝 P2 相比,转移所必须的功能改变如细胞迁移和增 癌患者的基因图谱。病人1(P1)有多个肿瘤病灶(低 值在P1 的病灶中十分显著,提示了肿瘤的侵袭性 分化肝癌) ,合并门静脉癌栓,生存时间很短;病 与病人预后的相关性。 人2(P2) 肝内有

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