Lammps并行安装成功版修改版.pdfVIP

Lammps 成功并行安装教程 制作者：zhjs 1. 首先，在/home 文件夹下建立两个文件夹，一个放安装文件（如software ），另一个作 为安装文件夹（如vm ），将安装包lammps，mpich，jpeg ，fftw 放到software 文件夹下， 全部解压。 注意：要在root 用户下安装 1.1 安装fftw ： 进入解压好的fftw 文件夹下，进入终端，执行： # ./configure --prefix=/home/vm/fftw3 --enable-float (=后面是安装路径，fftw3 表示我用的是fftw 第三版本) # make # make install 安装完成。。。。。。。。 1.2 安装mpich （我的mpich 也是3 版本的） 进入mpich 文件夹，进入终端，执行： # ./configure --prefix=/home/vm/mpich3 # make # make install 1.3 安装jpeg 库： 进入jpeg 文件夹，进入终端，执行： # ./configure --prefix=/home/vm/jpeg # make # make install 1.4 设置环境变量： 进入终端，执行： # cd # vi .bashrc 在文档下面添加mpich，jpeg 及fftw 的bin 路径和lib 路径： 添加： export PATH=/home/vm/mpich3/bin:/home/vm/fftw3/bin:/home/vm/jpeg/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/home/vm/mpich3/lib:/home/vm/fftw3/lib:/home/vm/jpeg/lib:$LD_LIBRARY_P ATH 保存后，回到终端，执行： # source .bashrc # echo $PATH 查看刚才的路径有没有添加上。 1.5 mpich 的特殊设置： 在终端执行： # cd # ifconfig -a 将会出现计算机的ip 找到里面出现第一个inet addr:xxx.xxx.xxx.xxx （如） 将这个ip 地址记下来 回到终端，执行： # vi /etc/hosts 在下面加上 xxx.xxx.xxx.xxx zhjs-pc zhjs-pc zhjs-pc 是我的计算机名称 保存。。。。。。。。。 到/etc 文件夹下创建名为mpd.conf 的空文件，在里面写上： MPD_SECRETWORD=mr45-j9z （等号后面的字符串随便写） 保存，然后在/etc 文件夹下进入终端，给这个文件加权限： # chmod 600 mpd.conf 完成。。。。。。 回到终端，输入： # mpd 若没有错误，说明设置正确 （本设置根据：/blog/static/1067682892011292423665/ ） 1.6 安装lammps： 将lammps 文件夹拷贝到/home/vm 下，进入lammps 文件夹下，进入lib 文件夹下 的某些文件夹，进行Makefile.xxx 的编译：（编译后都在其文件夹下出现 Makefile.lammps 文件） /act: # make –f Makefile.serial /awpmd: # make –f Makefile.openmpi /colvars: # make –f Makefile.g++ /linalg: # make –f M