生物信息学 - 医学数字资源中心 - 南方医科大学.doc

南方医科大学本科专业教学大纲 生物信息学 Bioinformatics 适用专业：生物信息学专业 执笔人：谭小丹 审定人：李彬 学院负责人：陈武凡 南方医科大学教务处 二○○六年十二月 课程编码：B030051 一、课程简介 生物信息学作为跨越生命科学和信息科学两大热点领域的学科展现了它蓬勃的生命力。面对人类基因组计划所产生的庞大的分子生物学信息，生物信息学的重要性将越来越突出，它无疑将会为生命科学的研究带来革命性的变革。本课程主要为生物信息学相关专业的本科生、研究生开设，系统地阐述了生物信息学的理论、技术与方法，内容涉及生物信息学的发生、发展和前沿动态，反映了国内外该领域的最新进展。 本课程72学时（54理论学时，18实验学时），3.5学分。先修课程：高等数学、计算机基础、生物学等。 Bioinformatics that integrates life science and information technology shows its promising future. Faced with the tremendous molecular biological information created by Human Genome Project, the significance of Bioinformatics has been more and more evident. Undoubtedly, it will bring a revolution to the research of life science. This course is suitable for undergraduate and graduate students whose major relevant to bioinformatics. It systematically illustrates the theories, technology and methods of bioinformatics. The content refers to the beginning, development and latest trends of bioinformatics, which reflects the latest development. This course includes 54 classes of lectures and 18 classes of experiments. The credit goes to 3.5. As prerequisites, this course assumes that the student is familiar with basic computer organization, advanced mathmatics, and biology, etc. 二、教学内容与要求 第一章 概论 【教学内容】 本章主要介绍生物信息学产生的背景、研究目标和内容、现状和展望等。 【教学要求】 掌握：生物信息学的概念、研究目标和内容 熟悉：生物信息学的主要意义 了解：生物信息学研究方法的新进展 第二章 生物学基础 【教学内容】 第1节 生命起源和分子进化 1、生命起源的三个阶段 2、生命起源的假说 3、生命起源物质组成的争论 第2节 生物的分类 1、单细胞或多细胞 2、细胞结构 3、遗传物质的组织 4、细胞的其他功能 5、分子水平 第3节 核酸 1、核酸的化学组成 2、DNA的一级结构 3、DNA的二级结构 4、DNA的三级结构 5、生物体中的DNA 6、RNA的结构 7、核酸的变性、复性与杂交 第4节 蛋白质 1、蛋白质的组成 2、蛋白质的分子结构 3、蛋白质结构预测和分子设计 第5节 染色体和基因 1、染色体和染色质 2、基因及真核生物基因组 第6节 中心法则 1、中心法则的内容 2、DNA的复制 第7节 基因工程技术简介 1、基因克隆的技术路线 2、基因组文库 3、重组DNA技术在医学生物学中的应用 【教学要求】 掌握：核酸、蛋白质、基因的各级结构，中心法则 熟悉：基因工程技术、生命起源 第三章 生物信息数据库及其信息检索 【教学内容】 第1节??? 生物信息数据库的类型 第2节??? 序列数据库 1、核酸序列数据库 2、蛋白质序列数据库 第3节??? 结构数据库 1、蛋白质结构数据库 2、数据库结构显示程序 第4节??? 生物数据库的信息检索 1、Retrieve服务器 2、Entrez系统 3、SRS检索工具 第5节??? 向数据库提交数据 【教学要求】 掌握：序列数据库、结构数据库的结构 熟悉：生物数据库的检索，向数据库提交数据 了解：生物信息数据库