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生物分子概论Biomolecular Introduction 什么是生物分子？ 在超过90种天然存在的元素中大约只有30种是生命必须的，称为生物元素。生物元素都是在自然界丰度较高，容易得到，又能满足生命过程需要的元素。 C、H、O、N占生物元素总量的95%以上，其原子序数均在8以内。它们和S、P、K、Na、Ca、Mg、Cl共11种元素，构成生物体全部质量的99%以上，称为常量元素，原子序数均在20以内。另外16种元素称为微量元素，包括B, F, Si, Se, As, I, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Sn, Mo，原子序数在53以内。 生物体中最丰富的元素是H(49%)、O(25%)、C(25%)、N(0.27%)； 地壳中最丰富的元素是O(47%)、Si(28%)、Al(7.5%)、Fe(4.5%)； H、 O、 N 、C是根据适合性被选择的 元素越轻，形成的键越强 容易借助电子对分别形成1、2、3、4个共价键，还可以形成双键。 常量元素和微量元素对生物体的重要作用 氟(F) 是骨骼和牙釉的成分，以氟磷灰石的形式存在，可使骨晶体变大，坚硬并抗酸腐蚀。所以在饮食中添加氟可以预防龋齿。氟还可以治疗骨质疏松症。 但当水中氟含量达到每升2毫克时，会引起斑齿，牙釉无光，粉白色，严重时可产生洞穴。 锌（Zn）可以促进机体生长发育，促进核酸及蛋白质的生物合成，增强免疫及吞噬细胞的功能，抗氧化、抗衰老及抗癌作用。锌亦是超氧化物歧化酶的组成成分。 硒（Se）是谷胱甘肽过氧化物酶的成分。硒能刺激免疫球蛋白及抗体的产生，增强机体对疾病的抵抗力。硒缺乏是克山病的病因之一，而硒过多也可引起疾病，如亚硒酸盐可引起白内障。 钼（Mo）有抗癌作用，缺钼地区食管癌发病率高，钼构成亚硝酸还原酶（植物），降低环境中亚硝酸含量，减少致癌物亚硝胺的生成。 1.3.1 碳骨架是生物分子结构的基础 碳原子四个共价键的四面体性质。这两种性质对于碳所形成的线性、分支以及环状的化合物的惊人多样性是极为重要的。这种多样性可因N、O和H原子的参与而进一步扩大。 官能团是生物分子中化学性质比较活泼，容易发生化学反应的原子或基团。 官能团限定生物分子的主要性质。 官能团的性质总要受到分子其它部分电荷效应和立体效应的影响。 主要的官能团 (1)羟基(hydroxyl group) -OH “羟”的字和音都由“氢氧”二字拼合而成。 很多有机分子上含有羟基-OH，如醇、糖、核酸、蛋白质 羟基是典型的极性基团，与水可形成氢键，因此，分子上羟基越多，亲水性就越大。 苯环上连接羟基的化合物称为酚。 (2)羰基 (carbonyl group) C=O（-CHO醛基、CO 酮基、-COOH羧基） 羰基（羰的字和音均由碳氧二字拼合而成）,羰基（酮基）在碳链中间的化合物称为酮。 羰基在碳链末段的有两种形式，含-CHO的分子称为醛。 含-COOH的称为羧酸，羧基可解离产生氢离子而形成负电离子-COO-，因此，羧基是酸性基团。如果同时有2个羰基存在于苯环上称之为醌。 醛、酮、羧酸、醌化合物在细胞里很常见，尤其是酮和羧酸，如丙酮、β-酮丁酸（乙酰乙酸）、α-酮戊二酸、泛醌（辅酶Q）等。 (3)氨基(amino group)-NH2和亚氨基-NH- 体内含氨基和亚氨基的化合物种类很多，所有的氨基酸都含有氨基或亚氨基，如丙氨酸（含氨基）、脯氨酸（含亚氨基）。 氨基有极性，其中的氮原子电负性较强，可以结合氢离子而成-NH3 + 、=NH2+，因此，氨基和亚氨基是碱性基团。 (4)巯基(sulfhydryl group)-SH和二硫键-S-S- 巯的字和音均由氢硫二字拼合而成。有极性，在中性条件下不解离。 带有巯基的化合物最常见的是半胱氨酸HOOC-CH（NH2）-CH2-SH、谷胱甘肽G-SH 两个半胱氨酸的两个巯基可以脱氢氧化为胱氨酸而在分子中形成-S-S-结构，-S-S-称为二硫键（二硫桥） (5)磷酸基-H2PO4 体内含磷酸基的化合物非常广泛，如葡萄糖-6-磷酸，磷酸烯醇式丙酮酸，核苷酸和核酸，磷酸蛋白质等等。 2分子磷酸可以脱水缩合为焦磷酸酐（亦称焦磷酸酯），如ATP分子含有三个磷酸基，其中3个磷酸基之间含有2个磷酸酯（酐）键，此键断开时可释放大量能量，因此称为高能键。 (6)酯(ester)、酐(anhydride )、酰胺(amido group) 含氧酸与醇的脱水缩合产物称为酯。如甘油（丙三醇）和三分子脂肪酸脱水缩合形成的甘油三酯，即脂肪。 含氧酸与含氧酸的脱水缩合产物称为酐。 羧酸与氨的脱水缩合产物称为酰胺R-CO-NH2，在碳链中间的形式是-CO-NH-，称为酰胺键，蛋白质分子中氨基酸与氨基酸就是通过酰胺键连接的。 (7)杂环集碳架和官能团于