工业材料200011p156张修明 生物中的微观自组合系统.docVIP

工業材料200011p156張修明生物中的微觀自組合系統 作者／現職﹕張修明／梓馨生醫整合研究協會主任研究員／美國亞利桑那大學生理學博士 工業材料200011p156張修明生物中的微觀自組合系統 1 (A) 前言 1 (B) 自組合的熱力學基礎 1 (C) 磷脂自組合後可有多 種形態 2 (D) 微管柱的巨大蛋白質分子仍可自行組合 5 (E) 核酸鍊的自組合條件已可掌握 7 (F) 結語﹕跨領域科技時代來臨 8 (G) 參考資料 8 自組合系統是未來精密工業技術的新趨勢 ﹐目前所能掌握的技術有限。然而在生物界 ﹐幾乎所有生物系統中分子的聚散消長都是自發的。若能借鏡其中一些訣竅而應用到工業或製程中應可有精密化、微型化及經濟化的功效 。 本文簡述細胞中三種主要分子﹕構成細胞膜的磷脂 ﹐作為細胞骨架的微管柱蛋白質和去氧核醣核酸 ﹐其自組合的過程及影響因素。希望能夠跨領域激發一些靈感 ﹐提供一些新的技術思維 。 關錠詞 ﹕自組合(Self Assembly)、磷脂(Phospholipid)、膜(Membrane)、微管柱(Microtubule)、 去氧核醣核酸(DNA)﹐隻螺旋(Double Helix)﹐生物的(Biological)。 前言 工業技術現在已經進步到可以在微米的尺度加工或製造物件﹐因此高密度、微型式的製程是當然的趨勢﹐這在信號級和檢驗用系統的發展尤其明顯。 高密度和微型化固然可以降低材料成本﹐但也使得外施的加工和維修更為困難 ﹐一來因為尺度已超過人類感官的範圍﹐二來精密施工的工具和工資非常昂貴﹐因此防止或除去一粒老鼠屎以免壞了一鍋粥得需要新思維。 若是該用的材料都能適時就位﹐自動組合成正確的形態﹐執行應有的功能﹐那該多好。總之﹐是希望能讓事不失控﹐人不多管﹐錢不少賺。 自然界中除了人之外要賺錢的是沒有﹐不過能井然有序進行卻不必勞人類大駕的事還不少﹐譬如結晶。若能借鏡一二﹐啟發靈感﹐以利我生﹐不亦善哉。 生物體中結構分子的聚合離散﹐除了最初兩條單股的去氧核酸鍊要送作堆時可能得推一把外﹐其餘的均是自動自發。只要餓了吃﹐咽了睡﹐就能日積月累﹐由十微米疊到一米多﹐細胞數更是由單獨一個繁殖成10的13次方個。 其實就算只在一個典型的細胞 (每邊不超過10微米)內﹐其負責隔離內外的磷脂膜﹐支撐骨架的微管蛋白和傳之後代的去氧核酸鍊都是由單元結構在一般生理環境中自動組合的﹐了解這些範例分子如何與系統其他的組成分離而自行聚合﹐可作為有朝一日設計自組合系統的參考。 自組合的熱力學基礎 在參考這些例子之前﹐我們得先了解容許如此自組合現象發生的條件﹐日後才好準此要領﹐有所發明。生物體都是活在水中﹐更具體說是活在鹽水中。所以生物體中的所有構造都和水及電解質有密切作用。這和一般人造工業製品的存在環境不大相同﹐因此兩者在原料的選擇上會有相當的差異。而自行組合這個特性也暗示﹐其結構在某種環境會產生自發的不穩定狀態。此一不穩定態除了▲不影響其他的結構外﹐還必須能向有利的穩定結構轉變﹐同時也自行成群聚集。 了解這類轉變的熱力學性質可預知其可能的變化走向。若組合過程中的ΔG值為負﹐則代表此過程可使系統最後趨向穩定。 此外在生物系統中的某些Constrain他與一般工業中的不同﹐例如水中的電解質濃度分佈﹐須使得細胞各處的滲透壓相同。還有溫度的範圍必須在冰點以上﹐而又必須在會使蛋白質失去活性的極限之內。 生物體中各分子間的結合力最強的是共價鍵(約數百kJ/mole)﹐再來就是氫鍵(約數十kJ/mole﹐和凡得瓦鍵(約十數kJ/mole)。 而生物體內能量的擾動來源最大的是ATP水解 (釋放約30 kJ/mole﹐疏／親水趨勢 (例如 ﹕由水中每移一個疏水-CH2單元至油中可降低總能量約2 kJ/mole)和熱擾動(每上升攝氏一度增加2.5 kJ/mole)。 ?如此大小的能量比較容易影響氫鍵和凡瓦鍵的生成。因此在生物分子自組合過程中是以此類鍵的消長為主。 ?共價鍵因為能量過高.﹐因此如果沒有酵素的協助來促進其生成或斷裂﹐通常是不易自行發生變化的。酵素本身不隨化學反應改變﹐但是可以將反應物把持在最合適的位置﹐而增快了反應速率。 另外還有離子鍵﹐其在水溶液中的能量雖然不高﹐但是專一性不佳﹐在此較不普遍為生物分子所利用。各類化學鍵的鍵能如◆表一所示。 表一﹕生物中常見化學鍵鍵能 鍵能 共價鍵S-S 220kJ/moleC-C350kJ/moleC-OI@Okl/mnIeP-O420kJ/mo]eC-H4叨@J/mn@eC二C6叨U/mc屹C二C850U/mole離子鍵- 800 kJ/mole (~10in water)氫鍵10-14 kJ/mole几得瓦鍵n-lOkT/mnIe 以下我們由細胞外而內看看磷脂膜﹐骨架微管蛋白和去氧核酸鍊是如何組成的。 磷脂自